More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0036 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 742 aa  1463    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  50.59 
 
 		 740 aa  686    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  86.41 
 
 		 741 aa  1281    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 762 aa  597  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 679 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 772 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  36.59 
 
 		 734 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 679 aa  405  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 686 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 784 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  33.12 
 
 		 764 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 865 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 865 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  33.81 
 
 		 764 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 777 aa  365  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.5 
 
 		 763 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  33.85 
 
 		 768 aa  359  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  33.08 
 
 		 798 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 777 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  33.33 
 
 		 769 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 760 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 755 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  28.71 
 
 		 769 aa  351  4e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  28.52 
 
 		 769 aa  350  6e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  28.77 
 
 		 769 aa  349  9e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 705 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 705 aa  348  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 765 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 783 aa  344  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.82 
 
 		 764 aa  344  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 801 aa  344  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 808 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  33.68 
 
 		 770 aa  340  7e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  33.42 
 
 		 764 aa  339  9e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 767 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  34.13 
 
 		 774 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.06 
 
 		 789 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 762 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 766 aa  335  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  32.65 
 
 		 783 aa  335  3e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  32.13 
 
 		 770 aa  334  4e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 695 aa  334  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.81 
 
 		 785 aa  331  3e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  41.2 
 
 		 878 aa  331  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 934 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 781 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 769 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 769 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  33.67 
 
 		 769 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  33.84 
 
 		 769 aa  328  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  33.67 
 
 		 769 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 769 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 804 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 756 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  33.68 
 
 		 752 aa  324  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  35.16 
 
 		 832 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 911 aa  321  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 770 aa  320  9e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 		 864 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  35.39 
 
 		 864 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 2539 aa  317  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.39 
 
 		 864 aa  317  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.39 
 
 		 864 aa  317  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.39 
 
 		 864 aa  317  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  35.39 
 
 		 864 aa  317  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  32.45 
 
 		 1834 aa  316  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  36.12 
 
 		 1079 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  37.07 
 
 		 839 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.23 
 
 		 1960 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 896 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 896 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.12 
 
 		 1992 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 		 777 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 750 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  31.61 
 
 		 1987 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 952 aa  312  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.88 
 
 		 1866 aa  312  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 728 aa  312  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 649 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.92 
 
 		 2336 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 756 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  30.83 
 
 		 803 aa  311  4e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  31.81 
 
 		 1989 aa  310  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.97 
 
 		 1956 aa  310  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 753 aa  310  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 1065 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.45 
 
 		 1971 aa  308  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 706 aa  306  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.55 
 
 		 974 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  31.99 
 
 		 2301 aa  303  7.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 1974 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 758 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 2212 aa  300  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 		 607 aa  300  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  37.89 
 
 		 1089 aa  297  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 1832 aa  296  7e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 1907 aa  296  9e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  32.18 
 
 		 601 aa  296  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 977 aa  295  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  30.8 
 
 		 1643 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>