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for query gene RoseRS_0011 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0011  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  100 
 
 
270 aa  552  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161683  normal  0.149093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  87.41 
 
 
270 aa  488  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0940  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  67.83 
 
 
278 aa  391  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1867  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  59.56 
 
 
293 aa  342  5e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107933  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0218  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  61.45 
 
 
303 aa  340  1e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0245  deoxyribodipyrimidine photolyase  56.87 
 
 
298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1589  DNA photolyase FAD-binding  49.43 
 
 
271 aa  248  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  52.6 
 
 
420 aa  185  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3370  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  41.67 
 
 
410 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1389  putative deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.76 
 
 
405 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359515  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2809  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  42.93 
 
 
403 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29652  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0617  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  38.62 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.07426  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15661  DNA photolyase-like protein  40.6 
 
 
371 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.675982  normal  0.652082 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1458  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  35.63 
 
 
384 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.89887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0728  putative DNA photolyase  39.1 
 
 
371 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.947552  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4047  Deoxyribodipyrimidine photolyase-like  35.84 
 
 
371 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00445605  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.82 
 
 
435 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15621  DNA photolyase-like protein  34.04 
 
 
384 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.299984  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15471  DNA photolyase-like protein  34.57 
 
 
382 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15221  DNA photolyase-like protein  32.68 
 
 
378 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.408051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.38 
 
 
476 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0151  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.07 
 
 
497 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0953516  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.58 
 
 
462 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.94 
 
 
481 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.32 
 
 
425 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.02 
 
 
454 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.42 
 
 
481 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.71 
 
 
474 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.98 
 
 
477 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.42 
 
 
477 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.7 
 
 
467 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.15 
 
 
463 aa  89.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.33 
 
 
483 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1151  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.39 
 
 
452 aa  89.4  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.98 
 
 
500 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.44 
 
 
477 aa  89  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  32.68 
 
 
471 aa  89  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  34.32 
 
 
472 aa  88.6  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1380  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.64 
 
 
470 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866986  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  32.2 
 
 
471 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1611  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.83 
 
 
445 aa  88.2  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.43 
 
 
483 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.83 
 
 
497 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  33.79 
 
 
468 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.85 
 
 
479 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.98 
 
 
519 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.67 
 
 
487 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.98 
 
 
519 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4704  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.09 
 
 
459 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.940834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.34 
 
 
469 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.76 
 
 
454 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.51 
 
 
445 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.51 
 
 
445 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.51 
 
 
445 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  35.71 
 
 
474 aa  86.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.32 
 
 
493 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.8 
 
 
453 aa  85.9  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.91 
 
 
486 aa  85.9  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.57 
 
 
518 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0998  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.68 
 
 
457 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50142  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0276  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.41 
 
 
431 aa  85.5  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.24 
 
 
491 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0815  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.752894  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.53 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.84 
 
 
490 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.65 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0731  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.76 
 
 
457 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0430  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.36 
 
 
541 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0715  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.76 
 
 
457 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.721475  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.33 
 
 
490 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.09 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0465  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.06 
 
 
541 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.11 
 
 
511 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03091  putative DNA photolyase  29.58 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.13 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.23 
 
 
487 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0287  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.63 
 
 
478 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.85 
 
 
484 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.49 
 
 
475 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.83 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.48 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4333  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.8 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.652268 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.23 
 
 
487 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.23 
 
 
487 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4270  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.29 
 
 
473 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397965  normal  0.444789 
 
 
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NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.91 
 
 
481 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3030  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.75 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.63 
 
 
492 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
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NC_008816  A9601_03081  putative DNA photolyase  29.58 
 
 
477 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.34 
 
 
478 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_0465  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.5 
 
 
473 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_2777  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.5 
 
 
469 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.1 
 
 
480 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.47 
 
 
479 aa  82.8  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal 
 
 
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NC_008699  Noca_0778  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.18 
 
 
453 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.46 
 
 
486 aa  82.4  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.28 
 
 
480 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007520  Tcr_2125  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.75 
 
 
479 aa  82.4  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.82 
 
 
477 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_2257  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.8 
 
 
442 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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