37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0006 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  497  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4254  hypothetical protein  94.65 
 
 		 243 aa  474  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1692  hypothetical protein  63.32 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3402  hypothetical protein  54.55 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0994  hypothetical protein  42.86 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19810  Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase  43.07 
 
 		 267 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1171  hypothetical protein  44.21 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1934  hypothetical protein  44.58 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.019437  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2665  hypothetical protein  46.98 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4893  hypothetical protein  45.87 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379402  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5932  hypothetical protein  47.86 
 
 		 253 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0174628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2139  hypothetical protein  43.45 
 
 		 263 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2758  hypothetical protein  44.26 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2643  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase  46.35 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.654173  normal  0.264962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1835  hypothetical protein  45.34 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.15794  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12163  hypothetical protein  41.22 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.822562  normal  0.390759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2285  hypothetical protein  41.67 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2441  hypothetical protein  40.58 
 
 		 281 aa  180  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2778  hypothetical protein  42.58 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000110826  hitchhiker  0.0000594492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5401  hypothetical protein  40.36 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3155  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  39.77 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0715316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3217  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  39.77 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3167  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  39.77 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3046  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  39.48 
 
 		 270 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.889585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2321  hypothetical protein  41.7 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2167  hypothetical protein  41.92 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0665793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3451  hypothetical protein  41 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00447227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3480  phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic  38.35 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.244683  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2627  hypothetical protein  41.18 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16030  hypothetical protein  42.21 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0258  hypothetical protein  44.98 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.345068  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2103  hypothetical protein  38.67 
 
 		 254 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000498307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26360  Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase  40.16 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1953  hypothetical protein  39.37 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0110  hypothetical protein  40.24 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1835  hypothetical protein  39.26 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.675451  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_4918  predicted protein  26.5 
 
 		 238 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>