202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6169 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  54.51 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  48.34 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  44.11 
 
 		 276 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  43.44 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  42.54 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  40.76 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  41.59 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  40.34 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  40.34 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  40.34 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  40.18 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  39.5 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  39.5 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  39.92 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.33 
 
 		 245 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.33 
 
 		 245 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.33 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.33 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.33 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.33 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.33 
 
 		 242 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  40.44 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  39.24 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  41.12 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.57 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  39.91 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  39.91 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.4 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  36.4 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  39.39 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  36.4 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  36.4 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  36.7 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  38.66 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  38.84 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  36.41 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  36.25 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.76 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  38.79 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  38.5 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.02 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  38.89 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  39.38 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  36.65 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  33.63 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  34.17 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  35.06 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  34.38 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  33.16 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  33.87 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  31.17 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  30.1 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.94 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3004  protein-disulfide isomerase-like protein  30.7 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0227664  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  29.58 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.02 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.66 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  33.61 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  29.73 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.37 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.16 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  31.36 
 
 		 284 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  29.73 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  28.27 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  32.12 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  27.16 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  33.47 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.96 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.49 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.42 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.21 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.49 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.49 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  30.43 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  31.28 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  26.96 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.21 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.86 
 
 		 245 aa  92  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  25.11 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.11 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.44 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.44 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.44 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.44 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.17 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.82 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0642  thiol:disulfide interchange protein  31.63 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.374404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2069  protein disulfide isomerase  30.86 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.191559999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.31 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.03 
 
 		 264 aa  85.1  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.7 
 
 		 251 aa  85.1  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.68 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.55 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.55 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.55 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3766  protein-disulfide isomerase-like protein  25.94 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000298401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.68 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>