134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5884 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5884  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.810647  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5424  GCN5-related N-acetyltransferase  76.56 
 
 
137 aa  204  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.195359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  54.4 
 
 
134 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5731  GCN5-related N-acetyltransferase  48.41 
 
 
137 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0567857  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0740  GCN5-related N-acetyltransferase  27.73 
 
 
134 aa  57.8  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2108  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.124744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0543  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.38 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1693  GCN5-related N-acetyltransferase  34.95 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1379  acetyltransferase  22.88 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000349378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4298  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3488  hypothetical protein  27.66 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0164567  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  24.79 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0550  acetyltransferase, GNAT family  23.53 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000998948 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1193  acetyltransferase  21.85 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0617  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.351006  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2207  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0108675  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4783  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.85 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000302728  hitchhiker  0.00000145166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1749  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08300  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.7 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3046  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0028  acetyltransferase  28.18 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1996  acetyltransferase  28.18 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2606  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
134 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.504946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  29.82 
 
 
164 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  24.41 
 
 
150 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13460  GCN5-related N-acetyltransferase  22.77 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003043  acetyltransferase GNAT family  24.11 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2832  acetyltransferase  26.83 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2612  acetyltransferase  27.34 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0440411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2560  acetyltransferase  27.64 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0379943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2802  acetyltransferase  27.34 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.613256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  26.37 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171947  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.37 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0094  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.313389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1924  GCN5-related N-acetyltransferase  26.73 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2483  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
297 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435481  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6350  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
286 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64987  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2810  acetyltransferase, GNAT family  26.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000256383 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1100  acetyltransferase  24.73 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2529  acetyltransferase  29.2 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0100563  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
300 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1922  acetyltransferase  27.78 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2240  hypothetical protein  28.83 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0216182  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4975  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
190 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0471867  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0741  acetyltransferase  27.73 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.296931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2555  acetyltransferase  25.23 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1179  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0866  hypothetical protein  31.67 
 
 
401 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  0.503906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1794  GCN5-related N-acetyltransferase  21.54 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000157192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0921  acetyltransferase  27.73 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1348  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1391  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.13219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2736  GCN5-related N-acetyltransferase  24.55 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1906  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537884  hitchhiker  0.0000285957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  27.69 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  27.69 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  27.69 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0995  acetyltransferase  26.89 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0993  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0565892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.73273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4809  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546548  hitchhiker  0.000000000531373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0791  acetyltransferase  26.89 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000699744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0373782  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565261  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0831  acetyltransferase  26.89 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000546377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1157  acetyltransferase  28.57 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0487546  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18501  GNAT family acetyltransferase  24.04 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.715879  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18311  GNAT family acetyltransferase  25 
 
 
151 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.662175  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0411  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0206726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  28.46 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2852  acetyltransferase, GNAT family  30.21 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000771484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0740  acetyltransferase  26.05 
 
 
151 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000824265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0727  acetyltransferase  26.05 
 
 
151 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000686887  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3143  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
143 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.249751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2701  hypothetical protein  35.59 
 
 
399 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0811  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.61 
 
 
147 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1863  hypothetical protein  31.63 
 
 
421 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165564  normal  0.279872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1637  acetyltransferase  29.41 
 
 
140 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.240715  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3516  histone acetyltransferase HPA2/related acetyltransferase  36.11 
 
 
140 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2745  hypothetical protein  35.59 
 
 
399 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.834944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2731  hypothetical protein  35.59 
 
 
399 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  25.89 
 
 
131 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12444  hypothetical protein  36.21 
 
 
402 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.439735  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1479  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
136 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398514  normal  0.140631 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2811  acetyltransferase, gnat family  25.2 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4121  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
178 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1756  acetyltransferase (GNAT) family protein  32.53 
 
 
213 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.896774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0422  hypothetical protein  28.72 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0049  GCN5-related N-acetyltransferase  30.7 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0926  acetyltransferase  26.05 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.3472299999999997e-49 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>