36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5769 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  65.13 
 
 		 528 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  100 
 
 		 527 aa  1059    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  65.02 
 
 		 528 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  53.37 
 
 		 538 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  42.86 
 
 		 527 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  30.19 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  29.93 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  28.29 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  28.6 
 
 		 420 aa  159  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  28.64 
 
 		 424 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  28.39 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  29.09 
 
 		 402 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  29.8 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  30 
 
 		 401 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  24.37 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  30.8 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  30.05 
 
 		 385 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  26.37 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  30.72 
 
 		 412 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  31.33 
 
 		 366 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  31.65 
 
 		 433 aa  50.4  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  31.85 
 
 		 346 aa  50.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0584  secretory lipase  32.67 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  33.11 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  29.73 
 
 		 404 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  28.82 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  30.34 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  29.07 
 
 		 417 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  28.48 
 
 		 388 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  23.99 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  31.03 
 
 		 376 aa  44.3  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  28.17 
 
 		 383 aa  44.3  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  31.97 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  31.97 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  27.27 
 
 		 386 aa  43.5  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  28.67 
 
 		 375 aa  43.5  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>