More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5735 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 320 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  52.9 
 
 		 311 aa  330  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  51.47 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  51.77 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  54.55 
 
 		 310 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  51.94 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  54.61 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  51.95 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  55.93 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  48.56 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  48.24 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  48.06 
 
 		 315 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  53.29 
 
 		 351 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  50.33 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  52.96 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  52.96 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  56.88 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  47.59 
 
 		 318 aa  296  2e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  50.49 
 
 		 323 aa  292  6e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  47.73 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  46.73 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  47.73 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  51.46 
 
 		 311 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  49.51 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  48.87 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  48.87 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  50.33 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  48.06 
 
 		 329 aa  278  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  48.87 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  47.08 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  48.58 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  48.87 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.18 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.18 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  49.19 
 
 		 326 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.18 
 
 		 342 aa  275  8e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  49.19 
 
 		 324 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  48.04 
 
 		 326 aa  275  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  48.05 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  48.87 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  48.87 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  47.91 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  48.73 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  48.7 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.21 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  48.39 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.54 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  47.06 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  48.55 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  48.54 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.75 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  50.48 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  47.25 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  48.86 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  46.36 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5957  KpsF/GutQ family protein  45.16 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  47.57 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  46.28 
 
 		 323 aa  265  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  48.05 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  47.57 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  42.67 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  41.88 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  43.09 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  45.48 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  43.09 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  48.71 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  43.09 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  44.84 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  42.9 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45.16 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  48.08 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  45.75 
 
 		 323 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.93 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  43.63 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  48.71 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  45.4 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  44.77 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  45.08 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  48.22 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  47.44 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.1 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  44.44 
 
 		 321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  48.87 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.89 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  45.78 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  49.51 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  42.53 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.23 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  45.19 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.25 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  45.57 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  45.57 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  43.95 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>