15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5677 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5677  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin NimC  100 
 
 		 419 aa  818    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4374  hypothetical protein  70.41 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4506  hypothetical protein  70.41 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5656  hypothetical protein  70.77 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3917  hypothetical protein  59.41 
 
 		 456 aa  332  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0283416  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1679  hypothetical protein  37.15 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2803  Outer membrane efflux protein  34.29 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2707  outer membrane efflux protein  32.93 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1463  outer membrane efflux protein  33.02 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00099491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0144  hypothetical protein  33.1 
 
 		 420 aa  113  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.903633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3710  outer membrane efflux protein  32.37 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1861  efflux family outer membrane protein  23.41 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  29.05 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  30.53 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1330  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.35 
 
 		 493 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>