More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5605 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  100 
 
 		 216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  67.77 
 
 		 223 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  67.77 
 
 		 219 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  66.82 
 
 		 219 aa  305  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  65.28 
 
 		 219 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  67.62 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  67.62 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  67.62 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  67.62 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  67.62 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  67.62 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  65.4 
 
 		 217 aa  302  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  65.88 
 
 		 219 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  65.88 
 
 		 219 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  65.88 
 
 		 219 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  68.25 
 
 		 220 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  67.14 
 
 		 219 aa  300  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  67.14 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  67.14 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  65.58 
 
 		 219 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  65.58 
 
 		 219 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  65.58 
 
 		 219 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  65.58 
 
 		 219 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  65.58 
 
 		 219 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  65.12 
 
 		 219 aa  297  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  65.89 
 
 		 219 aa  297  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  67.3 
 
 		 220 aa  296  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  65.89 
 
 		 219 aa  295  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  64.49 
 
 		 219 aa  293  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  68.14 
 
 		 239 aa  291  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  62.56 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  63.55 
 
 		 234 aa  287  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  61.9 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  60.95 
 
 		 211 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  57.21 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  57.21 
 
 		 211 aa  258  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  55.29 
 
 		 211 aa  248  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  52.71 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  51.72 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  51.72 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  51.72 
 
 		 239 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  51.72 
 
 		 239 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  50.23 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  52.43 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  51.23 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  49.77 
 
 		 242 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  49.02 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  50.24 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  50.74 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  47.91 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  49.28 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  50.71 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  51.96 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  48.65 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  55.94 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  47.95 
 
 		 258 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  47.3 
 
 		 251 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  50.73 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  48.06 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  44.83 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  52.22 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  46.57 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  46.53 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  46.53 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  49.75 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  43.07 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  42.93 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  45.1 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  43.4 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  41.35 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  38.53 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  38.1 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  38.57 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  38.57 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  42.86 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  38.68 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  38.07 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  48.24 
 
 		 182 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  36.27 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  42.23 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  38.95 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  37.86 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  38.1 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  39.32 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  41.58 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  38.89 
 
 		 749 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  40.09 
 
 		 877 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  36.19 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  36.45 
 
 		 754 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0263  hypothetical protein  38.38 
 
 		 194 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.24835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  39.32 
 
 		 228 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  37.44 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  33.97 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  38.27 
 
 		 726 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  37.21 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  41.99 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  38.79 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>