More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5532 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
267 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
218 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  43.67 
 
 
261 aa  208  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
303 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3597  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
279 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010454  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
246 aa  129  4e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  33.33 
 
 
243 aa  111  2e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  31.47 
 
 
239 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
238 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  31.52 
 
 
255 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  31.32 
 
 
242 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  32.4 
 
 
241 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  29.96 
 
 
241 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
238 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  31.44 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2821  regulatory protein GntR HTH  34.07 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  35.03 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  34.56 
 
 
268 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  34.68 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  33.97 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 
235 aa  92  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  29.87 
 
 
237 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  34.92 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  3.78938e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  35.2 
 
 
255 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
255 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  35.2 
 
 
255 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  31.14 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  36.31 
 
 
231 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.13 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  31.38 
 
 
251 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.7 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.74 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.7 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2385  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.655367  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.64 
 
 
233 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.29 
 
 
259 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 
226 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  32.57 
 
 
239 aa  85.1  1e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
270 aa  84.7  1e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  26.67 
 
 
270 aa  85.1  1e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  5.482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  27.01 
 
 
232 aa  85.1  1e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
242 aa  84  2e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
318 aa  84.7  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
239 aa  83.6  3e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
239 aa  83.6  3e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
261 aa  83.6  3e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
261 aa  83.6  3e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
261 aa  83.6  3e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
239 aa  83.6  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  36.09 
 
 
252 aa  83.6  3e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  30.47 
 
 
259 aa  83.2  4e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 
257 aa  83.2  4e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  31.21 
 
 
248 aa  83.2  4e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  29.74 
 
 
234 aa  82.8  5e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 
254 aa  82.8  5e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
366 aa  82.8  5e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 
247 aa  82.8  5e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
257 aa  82.8  5e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
228 aa  82.4  6e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  34.27 
 
 
253 aa  82.8  6e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.07 
 
 
251 aa  82.8  6e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  30.14 
 
 
240 aa  82.4  7e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
254 aa  82  8e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  28.63 
 
 
258 aa  82  8e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  30.04 
 
 
259 aa  82  8e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  29.02 
 
 
235 aa  82  9e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.96 
 
 
245 aa  81.3  1e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.85286e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  28.51 
 
 
265 aa  82  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  30.58 
 
 
248 aa  81.6  1e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  30.86 
 
 
261 aa  81.3  1e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1447  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
243 aa  81.6  1e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  28.65 
 
 
230 aa  82  1e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 
227 aa  80.9  2e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
277 aa  80.9  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
248 aa  80.9  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
257 aa  80.9  2e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 
233 aa  80.9  2e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
261 aa  80.5  2e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.1 
 
 
251 aa  80.9  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  29.66 
 
 
255 aa  80.5  3e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  33.33 
 
 
242 aa  80.1  3e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  35.56 
 
 
271 aa  80.1  3e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.11 
 
 
239 aa  80.5  3e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  34.08 
 
 
253 aa  79.7  4e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  29.28 
 
 
251 aa  80.1  4e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.08 
 
 
258 aa  79.3  5e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  34.88 
 
 
227 aa  79.7  5e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  31.76 
 
 
258 aa  79.7  5e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
242 aa  79.3  5e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.08 
 
 
258 aa  79.3  5e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
242 aa  79.3  5e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  33.71 
 
 
260 aa  79.7  5e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
242 aa  79.3  5e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.7 
 
 
250 aa  79.7  5e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  34.08 
 
 
258 aa  79.3  6e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>