61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5442 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5442  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding)-like protein  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4575  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  77.78 
 
 		 190 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486402  normal  0.92347 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2079  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding)-like  76.96 
 
 		 191 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105584  normal  0.435013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1118  GlpP family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 188 aa  271  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2463  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  57.3 
 
 		 191 aa  237  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4359  glycerol uptake operon antiterminator  43.78 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0128  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  29.61 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0526  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  29.31 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08130  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  25.95 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0616  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  32.61 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2092  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  25.43 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0958  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  26.38 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000321337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1193  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  26.38 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000179213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1104  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  26.38 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.44575e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1024  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  26.38 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0936  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  26.38 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0945  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  26.38 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000110817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1123  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  25.77 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000733013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4235  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  25.77 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000071595  decreased coverage  0.00000000285878 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0933  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  24.58 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0946  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  24.54 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000040322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1064  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  25.15 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000121142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2465  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  25.84 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1388  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  22.54 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1323  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  24.16 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00224266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2908  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  24.72 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3070  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (mRNA-binding), glpp  24.72 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02613  predicted anti-terminator regulatory protein  24.72 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4023  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  24.72 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0920  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  24.72 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2897  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  24.72 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0944  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  24.72 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.346113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02576  hypothetical protein  24.72 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1018  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  25.56 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0805  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  23.93 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0602  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  30.94 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0476  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (G3P_antiterm)  30.22 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0621  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  30.22 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0478  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator (G3P_antiterm)  30.22 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3105  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  24.16 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0791634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4737  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  30.22 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0628  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein, putative  30.22 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0696  putative glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  30.22 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0479  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  30.28 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2847  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  26.67 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000025966  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1363  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  25.35 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1062  glycerol uptake operon antiterminator  29.51 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0130  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator  24.66 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0865  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  23.93 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0752666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0565  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  29.5 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0534  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  29.5 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0280  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  23.78 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2877  glycerol uptake operon antiterminator  21.79 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0050  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  30.97 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2560  glycerol uptake operon antiterminator  21.23 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1492  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  21.91 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0319  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  21.51 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1383  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  20.25 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000112502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1357  glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein  20.25 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1558  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  29.44 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0883  glycerol-3-phosphate responsive antiterminator, GlpP  29.71 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>