More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5332 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  100 
 
 		 471 aa  932    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  64.16 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  57.08 
 
 		 466 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.42 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 469 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 470 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 495 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  34 
 
 		 481 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 459 aa  187  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 478 aa  187  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  35.64 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.79 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 500 aa  183  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 469 aa  183  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 466 aa  183  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 504 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.54 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 464 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.65 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1213  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  29.29 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  39.4 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 447 aa  167  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 467 aa  167  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  37.06 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.72 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  33.58 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.9 
 
 		 490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 524 aa  162  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  31.49 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 467 aa  160  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 467 aa  159  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  32.04 
 
 		 592 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.43 
 
 		 462 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 478 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  35.79 
 
 		 464 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 477 aa  156  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  31.21 
 
 		 357 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  35.94 
 
 		 465 aa  156  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.04 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  35.42 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  35.42 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  35.42 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  35.42 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  35.42 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  37.9 
 
 		 343 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.76 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 515 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  30.82 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  33.17 
 
 		 490 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  31.22 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  29.57 
 
 		 482 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  32.92 
 
 		 469 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 532 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 532 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  30.42 
 
 		 480 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 458 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 517 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.97 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  30.3 
 
 		 357 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  29.49 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 406 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  29.32 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  30.82 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  29.32 
 
 		 482 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 490 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 480 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  35.42 
 
 		 715 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  30 
 
 		 482 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 490 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  38.13 
 
 		 489 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 488 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 524 aa  150  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>