100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5282 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  685    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  50.84 
 
 		 326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  45.08 
 
 		 335 aa  269  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  42.03 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  38.25 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  37.79 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  35.62 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  31.84 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  45.83 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  29.75 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  31.66 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  33.16 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1714  hypothetical protein  41.86 
 
 		 139 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  33.51 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  33.49 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  33.02 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  32.67 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  31.58 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  29.09 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  31.66 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  28.34 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  29.41 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  29.81 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  31.25 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  27.98 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  27.97 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  26.73 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  28.03 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  26.89 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  28.96 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  29.06 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  27.85 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  28.96 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  27.54 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  30.53 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2606  hypothetical protein  26.54 
 
 		 279 aa  52.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  25.44 
 
 		 292 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  24.12 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  27.6 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  25.33 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  28.18 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  28.44 
 
 		 886 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  31.25 
 
 		 281 aa  50.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  25.34 
 
 		 310 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  24.5 
 
 		 254 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  35.2 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  34.55 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  33.91 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  22.39 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  27.7 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  32.46 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.55 
 
 		 688 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  34.26 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  32.46 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  33.56 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  31.58 
 
 		 498 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  21.2 
 
 		 264 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  24.53 
 
 		 411 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1494  phospholipase/carboxylesterase  29.61 
 
 		 256 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.259302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  28.71 
 
 		 219 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.33 
 
 		 688 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  32.23 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0666  dienelactone hydrolase  23.08 
 
 		 284 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  32.17 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  28.36 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  28.81 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  28.46 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  31.19 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0053  dienelactone hydrolase  23.47 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  26.84 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  26.67 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  21.5 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  21.82 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  29.67 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  25.11 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  27.32 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  24.21 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  24.18 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  31.25 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  28.49 
 
 		 700 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  30.28 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  27.57 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  22.58 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  26.67 
 
 		 218 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  31.25 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0796  Acetyl xylan esterase  32.12 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.513241  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  21.46 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  25.11 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  26.28 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0870  Acetyl xylan esterase  27.91 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  22.17 
 
 		 270 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  27.47 
 
 		 277 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.76 
 
 		 684 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  34.04 
 
 		 467 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.32 
 
 		 256 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  24.18 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3101  Acetyl xylan esterase  33.58 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  20.64 
 
 		 290 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5287  Dipeptidyl-peptidase IV  26.06 
 
 		 683 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>