More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5273 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 322 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  58.72 
 
 		 326 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  53.44 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  52.19 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  54.79 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  50.5 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  50.5 
 
 		 330 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47 
 
 		 325 aa  299  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  48.23 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.84 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  47.6 
 
 		 328 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.96 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  50 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.25 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  47.47 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  47.47 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.26 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  47.49 
 
 		 360 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.92 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  47.32 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  47.32 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.99 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.54 
 
 		 325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.41 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.86 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  44.94 
 
 		 320 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  44.62 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.08 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  43.79 
 
 		 351 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.92 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.78 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.58 
 
 		 328 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46.9 
 
 		 353 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  44.94 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.78 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.03 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  45.52 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  45 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  41.75 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.55 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  45.03 
 
 		 326 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  46.31 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45.86 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  46.33 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  43.08 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  44.15 
 
 		 323 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.32 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  42.81 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  44.37 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  43.46 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.03 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  44.7 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.09 
 
 		 331 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  43.85 
 
 		 323 aa  262  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.22 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  42.5 
 
 		 326 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  47.42 
 
 		 323 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.97 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.75 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  41.81 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  44.79 
 
 		 336 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  42.01 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 345 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  44.3 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.99 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  43.61 
 
 		 331 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  41.85 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  45.3 
 
 		 317 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  41.06 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.67 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  41.72 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  43.83 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  42.9 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  44.97 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.46 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.96 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.93 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.56 
 
 		 334 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  41.2 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.67 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  42.53 
 
 		 339 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.14 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  44.71 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.99 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  41.95 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  42.41 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  42.36 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.9 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.62 
 
 		 338 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.69 
 
 		 335 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  43.22 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  41.43 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.67 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.33 
 
 		 327 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  42.33 
 
 		 343 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.28 
 
 		 332 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  45.97 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.26 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.95 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>