252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5262 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  100 
 
 
337 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5098  flagellar motor switch protein G  88.43 
 
 
337 aa  600  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1575  flagellar motor switch protein G  66.26 
 
 
330 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2948  flagellar motor switch protein G  66.26 
 
 
330 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2530  flagellar motor switch protein G  64.72 
 
 
333 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1541  flagellar motor switch protein G  65.34 
 
 
330 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1709  flagellar motor switch protein FliG  64.11 
 
 
331 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.311791  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1245  flagellar motor switch protein G  64.11 
 
 
331 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2039  flagellar motor switch protein G  64.11 
 
 
331 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2715  flagellar motor switch protein G  64.11 
 
 
331 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2172  flagellar motor switch protein G  64.11 
 
 
331 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.450504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24220  flagellar motor switch protein  64.11 
 
 
331 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00171195  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1890  flagellar motor switch protein G  65.34 
 
 
330 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1703  flagellar motor switch protein G  64.11 
 
 
331 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0342564 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2576  flagellar motor switch protein G  65.03 
 
 
330 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0189022  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2133  flagellar motor switch protein G  64.11 
 
 
331 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1149  flagellar motor switch protein G  64.11 
 
 
331 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1272  flagellar motor switch protein G  64.11 
 
 
331 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.674292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1956  flagellar motor switch protein FliG  65.03 
 
 
331 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2186  flagellar motor switch protein G  64.11 
 
 
331 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.296587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2128  flagellar motor switch protein G  64.11 
 
 
331 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2291  flagellar motor switch protein G  63.19 
 
 
330 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.60642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2013  flagellar motor switch protein G  63.19 
 
 
330 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  63.19 
 
 
330 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3062  flagellar motor switch protein G  63.53 
 
 
331 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  63.53 
 
 
331 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2451  flagellar motor switch protein G  63.83 
 
 
331 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00544517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3110  flagellar motor switch protein G  63.83 
 
 
331 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3065  flagellar motor switch protein G  63.83 
 
 
331 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00336873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  63.83 
 
 
331 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  62.61 
 
 
331 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  62.61 
 
 
331 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6414  flagellar motor switch protein G  63.83 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2945  flagellar motor switch protein G  62.61 
 
 
331 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3084  flagellar motor switch protein G  63.83 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  62.61 
 
 
331 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  62.61 
 
 
331 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3771  flagellar motor switch protein G  62.31 
 
 
331 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0165  flagellar motor switch protein G  62.61 
 
 
331 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2143  flagellar motor switch protein G  62.31 
 
 
331 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3401  flagellar motor switch protein G  62.31 
 
 
331 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4169  flagellar motor switch protein FliG  61.7 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  61.7 
 
 
331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  60 
 
 
334 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  56.33 
 
 
331 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4730  flagellar motor switch protein G  58.66 
 
 
330 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.231859  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3653  flagellar motor switch protein G  58.66 
 
 
330 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.552774 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0391  flagellar motor switch protein G  57.14 
 
 
330 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977742  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  55.18 
 
 
333 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  55.62 
 
 
331 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1346  flagellar motor switch protein FliG  55.29 
 
 
332 aa  360  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  54.94 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  54.35 
 
 
333 aa  355  7.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  52.12 
 
 
331 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  51.82 
 
 
331 aa  349  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  50.91 
 
 
333 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  51.52 
 
 
331 aa  344  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  52.12 
 
 
331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  50.3 
 
 
331 aa  331  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  49.7 
 
 
338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  48.77 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  47.56 
 
 
334 aa  315  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  46.63 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  47.13 
 
 
329 aa  301  8.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  45.99 
 
 
336 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  45.99 
 
 
336 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  47.83 
 
 
346 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  45.16 
 
 
337 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  45 
 
 
346 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  45 
 
 
339 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  45 
 
 
339 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  46.23 
 
 
339 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  44.74 
 
 
347 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  44.69 
 
 
351 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  44.38 
 
 
339 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  45 
 
 
333 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  44.17 
 
 
329 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  44.17 
 
 
329 aa  288  9e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  45.21 
 
 
338 aa  288  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  44.69 
 
 
338 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  44.89 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  44.38 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  44.58 
 
 
338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  45.62 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  42.41 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  43.17 
 
 
351 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  43.57 
 
 
345 aa  278  7e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  43.26 
 
 
348 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  43.26 
 
 
348 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  43.93 
 
 
349 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  42.95 
 
 
348 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  42.95 
 
 
348 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  42.63 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  42.63 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  42.63 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  42.63 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  42.32 
 
 
348 aa  272  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  42.32 
 
 
351 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  41.9 
 
 
350 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  42.37 
 
 
349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>