More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5258 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5258  putative flagellar protein  100 
 
 		 91 aa  184  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0170106 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5095  putative flagellar protein  75.9 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2893  flagellar related protein  65.52 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4161  flagellar biosynthesis protein  68.75 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2926  flagellar biosynthetic protein FlhB  62.79 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0171  flagellar biosynthetic protein FlhB  61.63 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.35881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3161  FlhB domain-containing protein  72.37 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3078  putative flagellar protein FhlB  63.95 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2445  putative flagellar protein FhlB  63.95 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.735918  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3059  putative flagellar protein FhlB  63.95 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0778  flagellar biosynthetic protein  65.06 
 
 		 93 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2369  flagellar protein FhlB-like protein  65.82 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0369  FlhB domain-containing protein  68.24 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6408  putative flagellar protein FhlB  62.79 
 
 		 105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.15037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3104  putative flagellar protein FhlB  58.06 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305769  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2970  putative flagellar protein FhlB  58.06 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0147408  normal  0.125746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3765  flagellar biosynthetic protein FlhB  59.3 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.943439 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0227  putative flagellar biosynthesis protein  60.47 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0421  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  60.47 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0303064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0205  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  60.47 
 
 		 108 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0239  putative flagellar biosynthesis protein  60.47 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2951  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  60.24 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2404  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  65.06 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2137  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  60.24 
 
 		 127 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.406507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1814  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  65.06 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0287709 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3056  putative flagellar protein FhlB  59.3 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1596  flagellar protein FhlB  61.54 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3286  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  62.67 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3395  flagellar biosynthetic protein FlhB domain-containing protein  62.67 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1343  flagellar biosynthetic protein-like protein  62.34 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1980  putative flagellar biosynthetic protein  63.16 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3417  FlhB domain-containing protein  58.82 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24290  flagellar protein  61.18 
 
 		 94 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3320  FlhB domain protein  63.16 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2029  flagellar protein FhlB-like protein  54.65 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00113086  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2549  FlhB domain-containing protein  43.37 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1353  FlhB domain-containing protein  43.21 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2270  FlhB domain-containing protein  44.74 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.381312  normal  0.112647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03076  uncharacterized C-terminal FlhB domain-containing protein  46.34 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3199  FlhB domain-containing protein  46.05 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1376  FlhB domain-containing protein  46.05 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1369  FlhB domain-containing protein  44.74 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.708638  hitchhiker  0.000555431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1309  FlhB domain-containing protein  44.74 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2899  FlhB domain-containing protein  43.53 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.152734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3417  hypothetical protein  49.35 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2909  FlhB domain-containing protein  43.53 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3041  FlhB domain-containing protein  43.53 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.595282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3039  FlhB domain-containing protein  42.11 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505506 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2505  hypothetical protein  46.84 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1645  FlhB domain-containing protein  40.79 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.961468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0648  hypothetical protein  45.24 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3258  FlhB domain-containing protein  43.75 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3034  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  44.05 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1464  FlhB domain-containing protein  42.35 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1393  FlhB domain-containing protein  42.11 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372355  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2635  hypothetical protein  45.57 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1105  hypothetical protein  45.88 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.372697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2361  flagellar biosynthesis protein  40.26 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0068  FlhB domain-containing protein  42.11 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1003  flagellar biosynthesis  42.86 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126325 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1330  FlhB domain-containing protein  39.02 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.391906  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0935  FlhB domain-containing protein  38.89 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1760  flagellar biosynthetic protein (FlhB)-like protein  45 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000598623  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0864  FlhB domain-containing protein  38.89 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.119652  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0839  FlhB domain-containing protein  38.75 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1836  flagellar protein FhlB-like cytoplasmic domain-containing protein  46.15 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000219189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3034  FlhB domain-containing protein  44.3 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2809  FlhB domain-containing protein  36.05 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1476  flagellar biosynthesis  40 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911114  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0996  FlhB domain-containing protein  38.89 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.480741  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1187  type III secretion exporter  44 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0752  flagellar protein FhlB-like protein  40.91 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1388  FlhB domain-containing protein  42.68 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0793  FlhB domain protein  42.67 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0720642  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0138  FlhB domain-containing protein  43.42 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0574  conserved hypothetical protein, possible flagellar biosynthesis protein  39.02 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1098  flagellar biosynthesis protein  42.86 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0859628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2827  hypothetical protein  42.05 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2399  flagellar protein FhlB-like protein  32.93 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.303724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0789  flagellar biosynthetic protein FlhB  48.05 
 
 		 374 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000340873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1160  FlhB domain-containing protein  40 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1121  FlhB domain-containing protein  40 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111049  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5615  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.71 
 
 		 380 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.891713  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0972  FlhB domain protein  39.76 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1864  flagellar protein FhlB-like protein  44.74 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.989751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1334  flagellar biosynthetic protein FlhB  44.87 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1538  flagellar protein FhlB-like protein  39.76 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1181  FlhB domain-containing protein  38.67 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2788  flhB-related protein  45.83 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4329  FlhB domain-containing protein  40.51 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3170  flagellar biosynthesis protein FlhB  44.87 
 
 		 405 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1578  type III secretion protein  39.74 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0759274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1400  type III secretion proteins, related to flagellar biosynthesis protein FlhB  39.74 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0429  cytoplasmic domain of flagellar protein FhlB-like protein  45.07 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.904356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3655  hypothetical protein  39.76 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1750  flagellar biosynthesis protein FlhB  41.77 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3370  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.59 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00184569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0249  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.59 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0976  flagellar protein FhlB-like protein  33.75 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0267  flagellar biosynthesis protein FlhB  43.59 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>