227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5254 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  79.01 
 
 		 498 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  100 
 
 		 490 aa  945    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  63.99 
 
 		 488 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  54.67 
 
 		 482 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  48.39 
 
 		 487 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  47.67 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  39.63 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  45.64 
 
 		 665 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  39.92 
 
 		 465 aa  296  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  38.84 
 
 		 445 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  44.84 
 
 		 685 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  39.51 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  39.51 
 
 		 468 aa  281  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  39.51 
 
 		 468 aa  279  7e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  39.51 
 
 		 468 aa  279  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  39.51 
 
 		 468 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  41.59 
 
 		 680 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  41.59 
 
 		 680 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  39.08 
 
 		 471 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  37.86 
 
 		 441 aa  277  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  39.2 
 
 		 466 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  37.4 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  39 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  39.07 
 
 		 466 aa  270  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  38.18 
 
 		 468 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  37.98 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  42.36 
 
 		 678 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  42.36 
 
 		 678 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.07 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  39.74 
 
 		 669 aa  260  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  36.53 
 
 		 467 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  36.53 
 
 		 467 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  36.53 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  39.07 
 
 		 677 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.83 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  36.35 
 
 		 452 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  33.81 
 
 		 458 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.32 
 
 		 477 aa  233  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.77 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  37.62 
 
 		 668 aa  230  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.64 
 
 		 499 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  34.63 
 
 		 477 aa  220  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  33.87 
 
 		 487 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  33.73 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.99 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.57 
 
 		 502 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.16 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  35.76 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.76 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.44 
 
 		 657 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  38.33 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.79 
 
 		 473 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.69 
 
 		 487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.69 
 
 		 457 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.98 
 
 		 476 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  30.88 
 
 		 456 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  31.45 
 
 		 469 aa  194  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.25 
 
 		 456 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.27 
 
 		 454 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.27 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.15 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  31.91 
 
 		 495 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.29 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 456 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 456 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.14 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.47 
 
 		 453 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  32 
 
 		 507 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  32 
 
 		 507 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.58 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  32 
 
 		 507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  32 
 
 		 507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  32 
 
 		 507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  32 
 
 		 507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.02 
 
 		 454 aa  183  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  31.8 
 
 		 507 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  32.55 
 
 		 500 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  34 
 
 		 505 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  34.64 
 
 		 472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.54 
 
 		 462 aa  180  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.6 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.36 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  31.4 
 
 		 513 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  34.67 
 
 		 692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  30.58 
 
 		 474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  28.93 
 
 		 454 aa  174  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.64 
 
 		 456 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3953  flagellar hook-associated protein  35.86 
 
 		 506 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.16 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  35.86 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  35.86 
 
 		 506 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.14 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3197  flagellar hook-associated protein 2  35.86 
 
 		 508 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3449  flagellar hook-associated protein 2  35.86 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0369122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1670  flagellar hook-associated protein 2  35.86 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  35.86 
 
 		 506 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3101  flagellar hook-associated protein 2  35.86 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.95 
 
 		 479 aa  170  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>