135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5197 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5197  putative cytochrome c  100 
 
 		 138 aa  284  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00308424  normal  0.125409 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7662  cytochrome c, class I  50.39 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1476  cytochrome c class I  66.23 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  44.29 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  45.33 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  43.42 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  40 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  47.95 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  45.95 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  38.3 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  35.64 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  38.3 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  45.95 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  35.59 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  45.95 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  45.95 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  45.95 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1179  cytochrome C552 precursor  47.89 
 
 		 171 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  45.95 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1018  cytochrome c family protein  45.95 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0243798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  36.27 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  46.05 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  42.65 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  41.33 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  40.62 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  36.08 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  41.1 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 404 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  42.03 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  34.02 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  42.65 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  42.65 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  43.42 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0318  cytochrome c class I  38.67 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00066919  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  46.38 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  39.08 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1962  cytochrome c family protein  41.18 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1630  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000303587  hitchhiker  0.0000000150302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  40.96 
 
 		 344 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3635  putative cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  42.25 
 
 		 218 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0728  cytochrome c, class I  44.29 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0783308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  36.84 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  41.1 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  38.37 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  40.85 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 800 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  40.28 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  34.82 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  40.28 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  0.00000000000521394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  34.25 
 
 		 1138 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0037  cytochrome c, class I  34.67 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000534033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  37.33 
 
 		 984 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  40.58 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3038  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277662  normal  0.17422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1565  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  40.28 
 
 		 941 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0987  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  39.44 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  36.11 
 
 		 909 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3583  cytochrome c, class I  45.07 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  40.58 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  40.58 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  40.58 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  40.58 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  40.58 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  40 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  35.21 
 
 		 1135 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2906  cytochrome c class I  45.07 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  31.62 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  36.36 
 
 		 918 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  35.42 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  34.02 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  32.43 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  32.88 
 
 		 908 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  40.28 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2196  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.252301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  32.58 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>