More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5185 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  100 
 
 		 225 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  43.9 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  43.9 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  44.39 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  41.28 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  177  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  40.83 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  43.41 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  39.71 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  40.19 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  42.59 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  38.18 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  42.52 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  41.63 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  37.67 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  40.09 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  40.57 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  39.71 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  40.09 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  41.15 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  43.14 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  43.69 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  41.59 
 
 		 877 aa  158  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  40.19 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  38.86 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  40.48 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  44.17 
 
 		 220 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  42.23 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  40.39 
 
 		 754 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  42.23 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  40.53 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  42.06 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  38.68 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  43.84 
 
 		 787 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  40.58 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  38.21 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  38.21 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  38.21 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  38.21 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  38.21 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  38.21 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  40 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  36.11 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  41.15 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  43.78 
 
 		 749 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  41.75 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  42.11 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  40.18 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  39.02 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  38.68 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  41.47 
 
 		 272 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  39.42 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  39.42 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  40.49 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  39.32 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  37.74 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.78 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  38.05 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  39.32 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  39.32 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  39.32 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  40.67 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  40.67 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 211 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  40.67 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  40.67 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  38.35 
 
 		 267 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  38.35 
 
 		 267 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  40.67 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  40.67 
 
 		 219 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  41.75 
 
 		 230 aa  148  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  40.7 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  40.28 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  39.53 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  40.28 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  40.76 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  41.46 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  41.26 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  39.51 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  37.86 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  38.83 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  39.13 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  41.43 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  35.75 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  35.75 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  35.29 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0095  Carbonate dehydratase  38.5 
 
 		 726 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431657  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  35.41 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  36.94 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  36.59 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  36.19 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  43.08 
 
 		 739 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5226  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 867 aa  138  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.27 
 
 		 216 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  34.45 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  35.24 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  36.97 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  35.65 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>