More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5145 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.44 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.8 
 
 		 265 aa  268  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  53.82 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.82 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 		 287 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.21 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  43.56 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.13 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4185  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.52 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4597  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6847  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  39.46 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 		 263 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  36.22 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.2 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  34.2 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.02 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.77 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  31.37 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 		 272 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.58 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.2 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.6 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.59 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.1 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>