More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5111 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  100 
 
 		 390 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  66.4 
 
 		 390 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  64.45 
 
 		 393 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  62.05 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  61.44 
 
 		 402 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  61.44 
 
 		 402 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  57.89 
 
 		 385 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  59.54 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  58.76 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  59.52 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  56.69 
 
 		 383 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  57.56 
 
 		 381 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  52.77 
 
 		 385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  54.74 
 
 		 383 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  55 
 
 		 384 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  54.52 
 
 		 389 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  50.4 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  48.41 
 
 		 382 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  45.08 
 
 		 388 aa  309  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  46.37 
 
 		 383 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  46.13 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  50 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  44.91 
 
 		 383 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  44.01 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  45.75 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  40.66 
 
 		 379 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  39.53 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  40.92 
 
 		 379 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  44.17 
 
 		 389 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  40.15 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  44.93 
 
 		 388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  43.09 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  43.36 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  43.75 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  40.63 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  42.62 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  39.73 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  41.41 
 
 		 388 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.44 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  41.62 
 
 		 390 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  43.77 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  40.73 
 
 		 382 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  45.35 
 
 		 387 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  43.31 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  41.06 
 
 		 382 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  41.26 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  42.12 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  39.42 
 
 		 381 aa  226  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  41.88 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  38.3 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  38.3 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  37.27 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  37.34 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.49 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.6 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  36.24 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.98 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.13 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.18 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 		 390 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.25 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 		 390 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.2 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  35.11 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  33.59 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  34.38 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  34.29 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  35.62 
 
 		 453 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.62 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  32.83 
 
 		 388 aa  186  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  40.51 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  31.08 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.47 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.52 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  35.94 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.7 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  35.31 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2744  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase, PaaJ-like  32.58 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0906041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  34.69 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  34.69 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  34.69 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  32.64 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.58 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  34.55 
 
 		 386 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  34.49 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  33.89 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  34.49 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  34.49 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  30.81 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  33.51 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.31 
 
 		 548 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.45 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  36.18 
 
 		 548 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.32 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  32.72 
 
 		 386 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  34.84 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>