More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5098 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  100 
 
 
459 aa  928    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  83.11 
 
 
458 aa  790    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  83.62 
 
 
459 aa  783    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  83.62 
 
 
459 aa  782    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3969  major facilitator transporter  78.65 
 
 
457 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502064  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  60.05 
 
 
461 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  60.05 
 
 
461 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  58.92 
 
 
484 aa  538  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  60.05 
 
 
461 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  56.84 
 
 
450 aa  518  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  56.26 
 
 
447 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  55.15 
 
 
456 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  58 
 
 
443 aa  498  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  54.44 
 
 
460 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  53.07 
 
 
459 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  49.77 
 
 
439 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.32 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  47.92 
 
 
438 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  44.89 
 
 
455 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  44.34 
 
 
439 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  43.25 
 
 
435 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  43.25 
 
 
435 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  43.25 
 
 
435 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  43.87 
 
 
439 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  44.95 
 
 
460 aa  351  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  43.63 
 
 
439 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  42.7 
 
 
461 aa  330  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.05 
 
 
441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 
438 aa  322  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  42.32 
 
 
439 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  42.03 
 
 
439 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.13 
 
 
438 aa  316  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 
435 aa  316  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.51 
 
 
439 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.2 
 
 
437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.51 
 
 
439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.51 
 
 
439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  40.37 
 
 
468 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  41.84 
 
 
433 aa  310  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  40.19 
 
 
442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 
452 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.05 
 
 
446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.27 
 
 
439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  43.15 
 
 
455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 
446 aa  307  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.12 
 
 
437 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  42.03 
 
 
439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.49 
 
 
452 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  40.75 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.79 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  41.16 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  41.57 
 
 
460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  41.57 
 
 
460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  38.67 
 
 
444 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  42.02 
 
 
452 aa  303  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  41.43 
 
 
445 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  41.43 
 
 
445 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  41.43 
 
 
445 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  38.46 
 
 
457 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  39.45 
 
 
457 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.28 
 
 
430 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  37.64 
 
 
466 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  39.45 
 
 
457 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  41.9 
 
 
445 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  39.46 
 
 
447 aa  299  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07050  arabinose efflux permease family protein  39.3 
 
 
429 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  40.62 
 
 
456 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
461 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 
465 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.35 
 
 
450 aa  295  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 
472 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  36.84 
 
 
444 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  35.91 
 
 
463 aa  293  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  38.93 
 
 
430 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  38.19 
 
 
443 aa  293  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  41.93 
 
 
430 aa  292  9e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  42.17 
 
 
457 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  40.86 
 
 
439 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  39.35 
 
 
433 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
456 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  40.1 
 
 
441 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 
432 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  36.61 
 
 
444 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  37.5 
 
 
463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  38.55 
 
 
433 aa  288  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
442 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  38.11 
 
 
436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  42.12 
 
 
482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  37.98 
 
 
439 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 
435 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3240  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 
466 aa  285  9e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  39.74 
 
 
454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  39.86 
 
 
445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  37.04 
 
 
452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  38.58 
 
 
442 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  41.44 
 
 
438 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  35.94 
 
 
465 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  39.52 
 
 
434 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>