More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4943 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 385 aa  773    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  77.66 
 
 		 385 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  77.2 
 
 		 387 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  77.92 
 
 		 385 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  77.66 
 
 		 385 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  77.92 
 
 		 385 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  77.14 
 
 		 385 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  77.14 
 
 		 385 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  76.62 
 
 		 385 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  59.74 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  59.74 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.26 
 
 		 402 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.74 
 
 		 388 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.52 
 
 		 389 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.52 
 
 		 389 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.7 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  59.9 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 		 391 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  54.24 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  54.92 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  59.13 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.5 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.4 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  58.61 
 
 		 387 aa  362  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.15 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.55 
 
 		 386 aa  360  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.36 
 
 		 382 aa  359  4e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.55 
 
 		 384 aa  342  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.7 
 
 		 387 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.51 
 
 		 387 aa  269  8e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.16 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.2 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.5 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.97 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  41 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.69 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 		 389 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.57 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.48 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 		 388 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 		 368 aa  225  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.6 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.41 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.16 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 		 383 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.16 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 		 384 aa  209  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 		 377 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2795  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.43 
 
 		 385 aa  209  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.54 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.48 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.57 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2942  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.95 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  36.16 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 		 384 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.01 
 
 		 383 aa  206  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 		 385 aa  205  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.96 
 
 		 400 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.14 
 
 		 382 aa  205  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 		 400 aa  205  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.62 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.64 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.96 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  33.96 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.16 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.68 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  36.36 
 
 		 388 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  36.39 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.26 
 
 		 400 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 400 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  35.56 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.85 
 
 		 388 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.18 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4043  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  37.41 
 
 		 408 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.72 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.13 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.53 
 
 		 384 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.22 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.92 
 
 		 382 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.83 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>