More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4929 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4929  glutathione S-transferase  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.574827  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3493  glutathione S-transferase  78.97 
 
 
244 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0558771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  79.15 
 
 
235 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  76.92 
 
 
362 aa  391  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  77.02 
 
 
235 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  78.11 
 
 
234 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  77.25 
 
 
234 aa  384  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.25 
 
 
234 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4836  glutathione S-transferase-like protein  77.25 
 
 
234 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  hitchhiker  0.00725172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  75.97 
 
 
234 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.25 
 
 
234 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  77.25 
 
 
234 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.25 
 
 
234 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  75.21 
 
 
234 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1961  putative glutathione S-transferase  75.21 
 
 
234 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1980  putative glutathione S-transferase  75.21 
 
 
234 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.97 
 
 
234 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1547  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.11 
 
 
234 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.39 
 
 
234 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  74.79 
 
 
234 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  75.86 
 
 
235 aa  374  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  74.79 
 
 
234 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0909  putative glutathione S-transferase  74.79 
 
 
234 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0259435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1151  glutathione S-transferase, putative  73.93 
 
 
234 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.66 
 
 
232 aa  370  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.14 
 
 
255 aa  367  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.1 
 
 
233 aa  359  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.86 
 
 
237 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  72.1 
 
 
234 aa  348  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4104  glutathione S-transferase family protein  70.56 
 
 
231 aa  347  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606268  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3677  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.56 
 
 
231 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145175  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3378  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.7 
 
 
231 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0234  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.39 
 
 
234 aa  346  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1760  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.13 
 
 
231 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0130582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.09 
 
 
234 aa  344  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.09 
 
 
234 aa  341  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.51 
 
 
235 aa  339  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  66.67 
 
 
234 aa  331  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.81 
 
 
240 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0127  glutathione S-transferase family protein  63.68 
 
 
234 aa  321  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  68.16 
 
 
231 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3326  Glutathione S-transferase domain protein  75.79 
 
 
205 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.92 
 
 
231 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  66.37 
 
 
232 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0512  glutathione S-transferase-like protein  63.23 
 
 
229 aa  308  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.624431  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0097  glutathione S-transferase-like protein  61.54 
 
 
234 aa  308  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0513  Glutathione S-transferase domain protein  63.56 
 
 
236 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0574717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  62.29 
 
 
236 aa  296  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.97 
 
 
235 aa  292  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2264  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.74 
 
 
238 aa  289  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  62.39 
 
 
232 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  56.6 
 
 
236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0456  glutathione S-transferase-like  56.65 
 
 
233 aa  268  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  53.33 
 
 
230 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.86 
 
 
230 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.86 
 
 
230 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.9 
 
 
230 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  51.9 
 
 
230 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.95 
 
 
230 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  49.77 
 
 
233 aa  207  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  49.52 
 
 
230 aa  207  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
233 aa  207  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  47.62 
 
 
230 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 
231 aa  204  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  45.92 
 
 
255 aa  204  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  49.05 
 
 
230 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  47.62 
 
 
230 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  50.46 
 
 
213 aa  198  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.19 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0891  glutathione S-transferase-like protein  50.97 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  49.53 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.68 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  45.71 
 
 
230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  44.76 
 
 
234 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.54 
 
 
232 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  45.24 
 
 
234 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.48 
 
 
222 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.98 
 
 
208 aa  188  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  46.01 
 
 
222 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.01 
 
 
222 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.01 
 
 
222 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  50.47 
 
 
239 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  44.39 
 
 
234 aa  188  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  44.76 
 
 
204 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 
222 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 
222 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  47.42 
 
 
220 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  45.54 
 
 
222 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.01 
 
 
222 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.93 
 
 
236 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.95 
 
 
235 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 
222 aa  185  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  48.11 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.19 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  49.29 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.75 
 
 
242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  46.48 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.55 
 
 
211 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  44.55 
 
 
211 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>