More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4924 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  318  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  90.45 
 
 		 157 aa  289  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  83.23 
 
 		 164 aa  263  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  83.23 
 
 		 164 aa  263  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  83.23 
 
 		 164 aa  263  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  83.23 
 
 		 155 aa  262  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  83.23 
 
 		 155 aa  262  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  83.23 
 
 		 155 aa  262  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  83.23 
 
 		 155 aa  262  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  82.05 
 
 		 157 aa  259  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  82.05 
 
 		 157 aa  259  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  81.41 
 
 		 157 aa  258  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  81.41 
 
 		 157 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  81.41 
 
 		 157 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  81.41 
 
 		 157 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  80.77 
 
 		 157 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  65.81 
 
 		 158 aa  221  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.12 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  43.95 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  45.57 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  42.68 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  44.74 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 171 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  41.06 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  42.68 
 
 		 171 aa  124  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 177 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  40.4 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 155 aa  123  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 202 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 229 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>