More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4898 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  100 
 
 		 313 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  75.56 
 
 		 312 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  73.04 
 
 		 303 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  71.57 
 
 		 306 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  71.62 
 
 		 306 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  61.79 
 
 		 294 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  61.13 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  53.21 
 
 		 291 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  45.07 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  49.43 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  44.78 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  38.95 
 
 		 290 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  38.01 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  37.45 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  37.07 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  36.43 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  37.66 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  36.4 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  35.6 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  32 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  39.88 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  33.86 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  37.5 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  30.11 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  27.42 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  34.43 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  36.84 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.15 
 
 		 760 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  40.96 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  28.22 
 
 		 728 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  34.97 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  27.63 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  38.42 
 
 		 748 aa  99.4  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  31.69 
 
 		 266 aa  99.4  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.67 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  28.4 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  32.96 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  25.86 
 
 		 741 aa  99  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  29.27 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.43 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  38.25 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  27.6 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  27.6 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  35.38 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  33.7 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  27.6 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.21 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  28.95 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  34.97 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  30.34 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  30.77 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  27.6 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  28 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  31.2 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.97 
 
 		 263 aa  96.3  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.97 
 
 		 263 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.97 
 
 		 263 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.33 
 
 		 311 aa  95.9  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.97 
 
 		 263 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  27.72 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  28.14 
 
 		 474 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  31.98 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  29.23 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  35.84 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  27.6 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.43 
 
 		 263 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  27.6 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  35.48 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.87 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  27.6 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  37.28 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  33.88 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.15 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  35.71 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  27.82 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  35.52 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33.88 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  27.6 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  27.6 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  29.69 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  29.43 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  26.67 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.81 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  37.28 
 
 		 279 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  36.41 
 
 		 348 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  29.77 
 
 		 257 aa  92.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  35.33 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  28.84 
 
 		 347 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  34.81 
 
 		 621 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  29.87 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  35.59 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  27.06 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  33.33 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  35.59 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.03 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  28.84 
 
 		 347 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  30.98 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  28.01 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  26.98 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  30.11 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>