122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4823 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4823  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00729669  normal  0.42509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5755  YheO domain-containing protein  69.95 
 
 		 216 aa  301  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00241536  hitchhiker  0.000000000000540056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3127  YheO domain protein  68.97 
 
 		 218 aa  294  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  68.34 
 
 		 210 aa  289  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4178  YheO domain-containing protein  67.16 
 
 		 236 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3881  YheO domain-containing protein  69.35 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0788485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3919  YheO-like  67.5 
 
 		 212 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  67.5 
 
 		 212 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5858  YheO domain-containing protein  67.5 
 
 		 212 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.575899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0153  YheO domain-containing protein  65.2 
 
 		 210 aa  280  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4342  YheO domain-containing protein  68.84 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1494  hypothetical protein  66.5 
 
 		 212 aa  276  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101034  normal  0.19833 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2555  YheO domain protein  63.82 
 
 		 206 aa  276  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2249  YheO domain protein  63.82 
 
 		 207 aa  274  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3404  YheO domain-containing protein  65.55 
 
 		 224 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04794  hypothetical protein  50.73 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3999  YheO domain protein  46.63 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4112  YheO domain protein  46.63 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4371  hypothetical protein  47.26 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2000  YheO domain-containing protein  43.41 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35427  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  31.28 
 
 		 224 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  29.76 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  32.85 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  28.5 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  31.19 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2227  hypothetical protein  35.23 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  31.16 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  32.14 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  28.57 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  31.58 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0038  YheO domain-containing protein  32.18 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  27.27 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2073  YheO domain protein  29.91 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0868612 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  28.08 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  29.08 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  25.24 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3568  YheO domain-containing protein  32.37 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634176  normal  0.263492 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0847  YheO domain-containing protein  29.05 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262344  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3937  hypothetical protein  29.05 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0928038  hitchhiker  0.00381937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14000  hypothetical protein  31.34 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234213  normal  0.0113357 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0364  YheO-like  29.05 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0722  YheO domain-containing protein  29.05 
 
 		 264 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2673  YheO domain-containing protein  29.41 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0819  YheO domain-containing protein  29.05 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229038  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0739  YheO domain-containing protein  29.05 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.074862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3430  YheO domain-containing protein  28.85 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0968  hypothetical protein  28.36 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2540  YheO domain-containing protein  29.56 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  27.88 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  26.54 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  26.42 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1071  hypothetical protein  30.33 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1241  hypothetical protein  28.36 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  28.43 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2524  YheO domain-containing protein  28.16 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0563238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  25.71 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  25 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  27.57 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5663  YheO domain protein  29.86 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  25.37 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  25.37 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  24.88 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  25.37 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  25.37 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  29.15 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  24.49 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  24.07 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  27.14 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  28.76 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  22.97 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  30.04 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  25.37 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  26.79 
 
 		 248 aa  72  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  24.88 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  24.52 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  26.79 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  23.11 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  30.35 
 
 		 580 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  24.88 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  24.88 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  25.24 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3192  hypothetical protein  27.45 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  24.51 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  26.67 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  26.67 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  26.67 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  25.84 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  25.84 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4191  hypothetical protein  29.68 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000545617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0520  YheO domain protein  31.91 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  24.14 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  24.06 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2654  YheO domain protein  20.87 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  25.48 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  26.32 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  24.63 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  24.63 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  24.63 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>