119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4822 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  84.79 
 
 		 728 aa  1274    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  74.93 
 
 		 728 aa  1147    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  70.9 
 
 		 592 aa  866    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  86.1 
 
 		 734 aa  1287    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  84.27 
 
 		 731 aa  1285    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  72.5 
 
 		 728 aa  1107    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  71.53 
 
 		 735 aa  1056    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  86.18 
 
 		 734 aa  1290    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  100 
 
 		 734 aa  1513    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  73.87 
 
 		 742 aa  1120    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  73.73 
 
 		 742 aa  1122    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  74.1 
 
 		 728 aa  1119    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  82.82 
 
 		 616 aa  1001    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  73.46 
 
 		 742 aa  1116    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  76.06 
 
 		 727 aa  1157    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  76.33 
 
 		 728 aa  1173    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  74.04 
 
 		 729 aa  1130    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  74.01 
 
 		 728 aa  1122    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  83.49 
 
 		 734 aa  1292    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  73.73 
 
 		 728 aa  1124    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  82.02 
 
 		 732 aa  1244    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  84.79 
 
 		 728 aa  1274    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  73.73 
 
 		 728 aa  1116    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  74.07 
 
 		 729 aa  1127    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  73.63 
 
 		 728 aa  1127    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  74.69 
 
 		 728 aa  1140    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  74.01 
 
 		 729 aa  1130    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  84.79 
 
 		 728 aa  1274    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  84.91 
 
 		 728 aa  1296    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  73.87 
 
 		 728 aa  1128    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  84.47 
 
 		 734 aa  1274    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  74.01 
 
 		 729 aa  1129    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  46.99 
 
 		 587 aa  524  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  46.05 
 
 		 586 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  46.05 
 
 		 586 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  46.05 
 
 		 586 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  46.05 
 
 		 586 aa  519  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  46.05 
 
 		 586 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  46.05 
 
 		 586 aa  519  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  46.22 
 
 		 586 aa  520  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  45.88 
 
 		 586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  45.88 
 
 		 586 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  45.91 
 
 		 578 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  46.3 
 
 		 587 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  45.88 
 
 		 586 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  45.04 
 
 		 611 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  44.87 
 
 		 611 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  44.87 
 
 		 597 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  44.87 
 
 		 597 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  45.53 
 
 		 586 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  47.16 
 
 		 588 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  47.16 
 
 		 588 aa  504  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  47.16 
 
 		 588 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  47.11 
 
 		 587 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  46.37 
 
 		 576 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  46.31 
 
 		 587 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  45.8 
 
 		 587 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  44.25 
 
 		 582 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  39.73 
 
 		 584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  37.99 
 
 		 592 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  34.84 
 
 		 536 aa  337  5.999999999999999e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  34.18 
 
 		 540 aa  290  6e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  28.05 
 
 		 618 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1341  OsmC family protein  36.72 
 
 		 133 aa  98.6  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0887  hypothetical protein  38.28 
 
 		 132 aa  92  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.873349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4221  OsmC family protein  34.38 
 
 		 135 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4072  hypothetical protein  34.38 
 
 		 134 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0853904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4196  OsmC family protein  34.38 
 
 		 135 aa  91.3  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1130  hypothetical protein  39.82 
 
 		 135 aa  90.9  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0382  hypothetical protein  34.09 
 
 		 134 aa  90.5  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0351  OsmC family protein  32.81 
 
 		 134 aa  90.5  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.999657  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1001  OsmC family protein  36 
 
 		 135 aa  89.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1489  OsmC family protein  34.96 
 
 		 181 aa  88.2  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.172419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1251  OsmC family protein  36.52 
 
 		 134 aa  87.8  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.106129  normal  0.568503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1429  OsmC family protein  36.75 
 
 		 135 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.640592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3476  OsmC family protein  32.06 
 
 		 135 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3179  OsmC family protein  34.58 
 
 		 159 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0335  OsmC family protein  30.77 
 
 		 127 aa  63.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.252391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  28.35 
 
 		 138 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  26.67 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3081  OsmC-like protein  26.32 
 
 		 134 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3682  hypothetical protein  34.26 
 
 		 125 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0395  OsmC family protein  26.79 
 
 		 138 aa  55.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2348  OsmC family protein  26.5 
 
 		 163 aa  55.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.684792  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4465  OsmC-like protein  26.85 
 
 		 248 aa  54.7  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  25.64 
 
 		 410 aa  54.7  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  26.85 
 
 		 584 aa  53.9  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  26.09 
 
 		 410 aa  54.3  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  28.63 
 
 		 572 aa  52.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  26.6 
 
 		 572 aa  53.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  28.21 
 
 		 151 aa  52.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  25.16 
 
 		 580 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  25.81 
 
 		 397 aa  52  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0361  OsmC family protein  26.45 
 
 		 140 aa  51.6  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2557  OsmC family protein  30.7 
 
 		 138 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000559572  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  28.7 
 
 		 134 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  21.43 
 
 		 409 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  23.7 
 
 		 402 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  20.34 
 
 		 407 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  27.02 
 
 		 584 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>