More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4790 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4790  NodT family outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 496 aa  1003    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.031941  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4081  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  62.63 
 
 		 517 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5459  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.94 
 
 		 493 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.0370061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6626  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  49.57 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3621  outer membrane efflux protein  48.52 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3381  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  50.22 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2615  aromatic acid efflux system NodT family outer membrane lipoprotein  49.13 
 
 		 510 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0179  RND efflux transporter  51.51 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0200  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.51 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.844152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5048  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.97 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0204  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.4 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0174  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  50 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6012  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.95 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7725  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.04 
 
 		 499 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5768  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.3 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20317  normal  0.984778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.18 
 
 		 486 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.940434  normal  0.118266 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6151  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.05 
 
 		 502 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.808287  normal  0.205282 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6180  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.76 
 
 		 498 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0879819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6660  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.76 
 
 		 498 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0870  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.58 
 
 		 493 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4319  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.03 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.239033  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3498  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.27 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.916304  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1154  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.78 
 
 		 473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182996  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3167  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.77 
 
 		 480 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0108  outer membrane efflux protein  41.98 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.998776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.97 
 
 		 465 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678758  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.49 
 
 		 478 aa  257  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.82 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.06 
 
 		 471 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.34 
 
 		 471 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2446  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 471 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.09 
 
 		 471 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3101  outer membrane efflux protein  34.51 
 
 		 465 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00986507  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4288  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.83 
 
 		 467 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22095  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2179  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.86 
 
 		 462 aa  243  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.159854  normal  0.0708517 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3191  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 		 497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.26 
 
 		 497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32380  multidrug efflux outer membrane protein OprN precursor  36.23 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0450823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2743  outer membrane protein OprN precursor  36.01 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.84 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1101  outer membrane protein  34.17 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2069  multidrug efflux MFS outer membrane protein, putative  34.82 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.51 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2115  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.99 
 
 		 497 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  30.27 
 
 		 489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  30.08 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2929  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.49 
 
 		 484 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  31.04 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1570  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.26 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  29.85 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1301  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.98 
 
 		 514 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1695  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.32 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2159  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.72 
 
 		 529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.32 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1267  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  32.19 
 
 		 512 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522165  normal  0.0121166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1016  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.46 
 
 		 512 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18790  putative outer membrane efflux protein  34.24 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0851472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.82 
 
 		 525 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3581  outer membrane protein OprN precursor  33.48 
 
 		 499 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.36 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48240  putative outer membrane component of multidrug efflux pump  35.2 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0030067  normal  0.0214896 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.8 
 
 		 495 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  30 
 
 		 479 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46400  Outer membrane protein  30 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.15 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.17 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.62 
 
 		 494 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  30 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.6 
 
 		 495 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.92 
 
 		 483 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.16245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.2 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3597  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.61 
 
 		 501 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.86 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.11 
 
 		 502 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.42 
 
 		 494 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414328  hitchhiker  0.00000000121747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  29.44 
 
 		 504 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.3 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  28.24 
 
 		 511 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.57 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1626  putative outer membrane efflux protein  33.95 
 
 		 495 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.92 
 
 		 483 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.63 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.04 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.84 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0890  outer membrane protein  30.85 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.189882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1273  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.47 
 
 		 484 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  27.54 
 
 		 483 aa  163  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000656  putative outer membrane protein  27.02 
 
 		 500 aa  163  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1666  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.25 
 
 		 546 aa  163  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0284  outer membrane efflux family protein  27.78 
 
 		 518 aa  162  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.38 
 
 		 501 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09500  outer membrane protein  31.88 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4126  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.48 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.69 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0563  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.24 
 
 		 519 aa  160  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5590  NodT family outer membrane lipoprotein  31.11 
 
 		 485 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  31.75 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4452  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.25 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0511722  normal  0.669116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1006  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.6 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0211246  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>