25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4776 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4776  putative N-acetyltransferase GNAT family  100 
 
 
155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000575429  normal  0.686301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1686  GCN5-related N-acetyltransferase  62.91 
 
 
152 aa  207  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.912407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  34.13 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0940  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25620  acetyltransferase  23.53 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6479  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
115 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2460  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
247 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5987  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2631  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.512633  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3357  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
219 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0588518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1439  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
244 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0379  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0771  putative acetyltransferase  35.9 
 
 
294 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6114  acetyltransferase  28.1 
 
 
385 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
300 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2417  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 
158 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000513372  hitchhiker  0.0048595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  42.86 
 
 
154 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
276 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1491  hypothetical protein  36.49 
 
 
290 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405441  hitchhiker  0.00239117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2798  acetyltransferase  35.29 
 
 
267 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.097578  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2004  acetyltransferase, GNAT family  43.64 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6566  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 
294 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
151 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.694453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
269 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.34789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>