More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4653 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  100 
 
 		 560 aa  1145    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  48.82 
 
 		 552 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  51.5 
 
 		 546 aa  534  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  46.47 
 
 		 548 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  47.48 
 
 		 565 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  46.14 
 
 		 550 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  46.72 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  44.32 
 
 		 619 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  44.12 
 
 		 553 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  44.38 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  49.21 
 
 		 553 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  47.38 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  47.44 
 
 		 565 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  43.25 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  38.91 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  40.4 
 
 		 543 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  37.45 
 
 		 544 aa  347  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  37.43 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  37.57 
 
 		 527 aa  325  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  36.75 
 
 		 530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  38.48 
 
 		 579 aa  316  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  41.65 
 
 		 536 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  35.98 
 
 		 556 aa  313  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  37.42 
 
 		 563 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  37.17 
 
 		 583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  35.79 
 
 		 556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  40.54 
 
 		 544 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  41.41 
 
 		 536 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  34.98 
 
 		 543 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  34.19 
 
 		 589 aa  292  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  40.12 
 
 		 532 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  36.38 
 
 		 542 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  37.1 
 
 		 522 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  35.42 
 
 		 542 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  32.71 
 
 		 522 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  32.16 
 
 		 522 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  41.48 
 
 		 532 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  36.08 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  31.75 
 
 		 533 aa  271  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  32.4 
 
 		 522 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  32.22 
 
 		 522 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  32.22 
 
 		 522 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  32.16 
 
 		 522 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  32.92 
 
 		 569 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  34.92 
 
 		 537 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  31.36 
 
 		 522 aa  264  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  31.47 
 
 		 520 aa  263  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  31.28 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  31.12 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  31.1 
 
 		 522 aa  252  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  31.17 
 
 		 574 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  28.68 
 
 		 539 aa  246  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  32.98 
 
 		 576 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  32.57 
 
 		 544 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  31.11 
 
 		 539 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  32.4 
 
 		 573 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  34.04 
 
 		 573 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  35.22 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.82 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  33.08 
 
 		 564 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  31.84 
 
 		 527 aa  230  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  32.54 
 
 		 541 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  32.47 
 
 		 544 aa  230  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 538 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.1 
 
 		 557 aa  222  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  34.48 
 
 		 545 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 548 aa  220  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  33.54 
 
 		 549 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  33.07 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  33.88 
 
 		 537 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  31.25 
 
 		 547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  31.62 
 
 		 537 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  32.36 
 
 		 569 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  32.81 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.85 
 
 		 545 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  31.43 
 
 		 603 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.06 
 
 		 549 aa  212  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  31.27 
 
 		 564 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  29.03 
 
 		 596 aa  209  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  30.54 
 
 		 558 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.71 
 
 		 546 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  32.25 
 
 		 620 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 582 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 606 aa  208  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  27.97 
 
 		 526 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  30.09 
 
 		 565 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  30.23 
 
 		 608 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  33.13 
 
 		 583 aa  207  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  33.6 
 
 		 543 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  33.2 
 
 		 485 aa  206  8e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.13 
 
 		 543 aa  204  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  29.74 
 
 		 531 aa  203  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 616 aa  202  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.97 
 
 		 564 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.4 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  30.44 
 
 		 613 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 589 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>