269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4648 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  784    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  81.23 
 
 		 374 aa  627  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  76.96 
 
 		 374 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  76.42 
 
 		 374 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  76.42 
 
 		 374 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  72.43 
 
 		 371 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  74.12 
 
 		 386 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  71.54 
 
 		 372 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  73.05 
 
 		 373 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  66.22 
 
 		 373 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  66.49 
 
 		 371 aa  497  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  63.81 
 
 		 365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  63.09 
 
 		 368 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  60.77 
 
 		 370 aa  454  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  59.19 
 
 		 376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  58.08 
 
 		 371 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  56.68 
 
 		 374 aa  419  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  51.79 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  54.7 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.4 
 
 		 373 aa  398  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.32 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.85 
 
 		 374 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  47.96 
 
 		 378 aa  342  7e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  47.68 
 
 		 378 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.87 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.43 
 
 		 318 aa  331  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  47.3 
 
 		 373 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  47.3 
 
 		 373 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.06 
 
 		 379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  46.72 
 
 		 386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.21 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.53 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.29 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.29 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.51 
 
 		 376 aa  298  8e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.48 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.02 
 
 		 371 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.02 
 
 		 371 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.7 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.27 
 
 		 376 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.55 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  43.75 
 
 		 371 aa  292  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.82 
 
 		 375 aa  292  7e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  40.27 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  42.67 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.47 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  39.95 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.95 
 
 		 376 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.89 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.94 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.44 
 
 		 370 aa  265  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.61 
 
 		 376 aa  253  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  43.87 
 
 		 364 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.16 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.99 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.99 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.97 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.13 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.35 
 
 		 343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  36.46 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.2 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.19 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  33.06 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.65 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.94 
 
 		 151 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  42.11 
 
 		 156 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.61 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  23.92 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  23.63 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  26.23 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.29 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.83 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3916  Fic family protein  26.07 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4959  Fic family protein  25.68 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.35 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.11 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1889  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 454 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  36.59 
 
 		 195 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  25.19 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.54 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.23 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1221  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.7 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  30.93 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.89 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1081  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.73 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.49 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.46 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.18 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  25.29 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.76 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  33.33 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.85 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.11 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.71 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  27.46 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.56 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.22 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.17 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.04 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>