More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4635 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6179  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  82.79 
 
 		 562 aa  845    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4635  sulfate transporter  100 
 
 		 578 aa  1128    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04796  putative sulfate transporter transmembrane protein  63.84 
 
 		 567 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0178454 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  62.88 
 
 		 570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1962  sulfate permease family protein  62.88 
 
 		 570 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0829811  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0137  sulfate permease family protein  62.88 
 
 		 570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1810  sulfate permease family inorganic anion transporter  62.88 
 
 		 570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1029  sulfate permease family inorganic anion transporter  62.88 
 
 		 570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  62.88 
 
 		 570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1758  sulfate permease family inorganic anion transporter  62.88 
 
 		 570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125807  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3995  sulphate transporter  61.92 
 
 		 573 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437247  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4108  sulphate transporter  61.92 
 
 		 573 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.206174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2524  sulfate permease family protein  62.76 
 
 		 570 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1515  sulphate transporter  63.64 
 
 		 571 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.020255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1059  sulphate transporter  63.83 
 
 		 571 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1539  sulphate transporter  63.83 
 
 		 571 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4679  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  61.76 
 
 		 576 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0998363  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1715  sulphate transporter  62.93 
 
 		 574 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2661  sulphate transporter  55.43 
 
 		 541 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955862  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1421  sulphate transporter  61.95 
 
 		 572 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1461  sulphate transporter  61.81 
 
 		 572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.297634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4170  sulphate transporter  45.4 
 
 		 536 aa  347  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1050  sulphate transporter  41.92 
 
 		 548 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.089361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0968  sulphate transporter  41.74 
 
 		 548 aa  286  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  38.36 
 
 		 583 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  33.4 
 
 		 571 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  33.47 
 
 		 584 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  33.67 
 
 		 557 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  29.92 
 
 		 580 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  32.55 
 
 		 565 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  30.32 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  31.12 
 
 		 596 aa  208  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  31.77 
 
 		 586 aa  208  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.21 
 
 		 572 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  32.34 
 
 		 572 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  30.59 
 
 		 590 aa  203  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  31.89 
 
 		 556 aa  203  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  29.67 
 
 		 578 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  28.68 
 
 		 583 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  30.66 
 
 		 565 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  29.41 
 
 		 586 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  34.39 
 
 		 576 aa  200  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  33.52 
 
 		 556 aa  200  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  30.19 
 
 		 576 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  27.9 
 
 		 579 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  34.21 
 
 		 556 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  32.67 
 
 		 588 aa  194  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  27.59 
 
 		 573 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  33.97 
 
 		 556 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  32.9 
 
 		 573 aa  189  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  28.38 
 
 		 595 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  29.22 
 
 		 573 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  34.36 
 
 		 551 aa  187  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.36 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  27.73 
 
 		 570 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  31.96 
 
 		 592 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  27.34 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  29.49 
 
 		 575 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  31.76 
 
 		 590 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  30.38 
 
 		 588 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  27.4 
 
 		 570 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  30.31 
 
 		 569 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  30.31 
 
 		 569 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  30.27 
 
 		 592 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  33.78 
 
 		 570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  32.82 
 
 		 591 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  31.72 
 
 		 585 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  28.88 
 
 		 568 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  28.88 
 
 		 568 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  28.39 
 
 		 578 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  30.87 
 
 		 599 aa  177  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  32.26 
 
 		 605 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  27.89 
 
 		 590 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  28.2 
 
 		 568 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  28.24 
 
 		 597 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  31.88 
 
 		 587 aa  173  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1584  sulphate transporter  33.73 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  32.58 
 
 		 550 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  32.89 
 
 		 610 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.89 
 
 		 610 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.89 
 
 		 610 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.89 
 
 		 610 aa  170  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  31.19 
 
 		 563 aa  170  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  27.81 
 
 		 588 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  32.2 
 
 		 576 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  31.82 
 
 		 610 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  31.82 
 
 		 610 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  31.82 
 
 		 610 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  28.54 
 
 		 582 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  27.96 
 
 		 574 aa  166  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  28.94 
 
 		 574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  27.89 
 
 		 567 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  28.99 
 
 		 575 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  28.75 
 
 		 730 aa  163  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  30.54 
 
 		 585 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  28.4 
 
 		 578 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  30.75 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  27.15 
 
 		 591 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  27.54 
 
 		 569 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  28.68 
 
 		 600 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>