79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4588 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  100 
 
 		 123 aa  236  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  91.87 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  65.04 
 
 		 123 aa  153  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  64.23 
 
 		 123 aa  153  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  63.41 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  63.41 
 
 		 123 aa  151  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  63.41 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  63.41 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  63.41 
 
 		 123 aa  151  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  63.41 
 
 		 123 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  66.96 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  66.96 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  66.96 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  66.96 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  66.96 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  66.96 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  66.96 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  60.16 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  60.98 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  64.35 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  64.35 
 
 		 141 aa  140  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  61.79 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  72.34 
 
 		 123 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  43.44 
 
 		 159 aa  89.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  44.83 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  43.97 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  35.54 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  43.24 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  39.5 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  37.82 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  38.4 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  44.44 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  44.44 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  34.91 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  31.4 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  34.78 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  31.97 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  31.97 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  31.97 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  31.43 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  50 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  38.16 
 
 		 284 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  40.58 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  51.72 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  27.05 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  36.28 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  34.69 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  28.91 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  34.13 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  26.23 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  37.23 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1035  hypothetical protein  33.86 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  30.47 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  32.35 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  28.3 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  43.1 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  32.73 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  22.41 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  31.88 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1588  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0451  small multidrug resistance protein  27.1 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.580088  hitchhiker  0.00482726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  35.4 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.28 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  36.76 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  41.38 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  29.31 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  29.31 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  27.73 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  41.38 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  35.62 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  25.62 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  29.52 
 
 		 115 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  42.37 
 
 		 119 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1355  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 113 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.908365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>