More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4466 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  74.95 
 
 
480 aa  686  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
480 aa  948  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  50.65 
 
 
465 aa  406  1e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  44.95 
 
 
467 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 
469 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
464 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
474 aa  315  1e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
472 aa  315  1e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
469 aa  306  8e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
469 aa  306  8e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
469 aa  305  1e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
463 aa  305  2e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
481 aa  304  2e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 
471 aa  302  7e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 
486 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
487 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
471 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
471 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
481 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  40.7 
 
 
486 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
476 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 
493 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  39.05 
 
 
476 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 
493 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
462 aa  296  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  41.51 
 
 
463 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  41.51 
 
 
463 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  39.01 
 
 
463 aa  290  5e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.91 
 
 
468 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.26 
 
 
471 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
466 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  38.34 
 
 
466 aa  285  2e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  40.38 
 
 
464 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  41.52 
 
 
462 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
486 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
486 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
462 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
465 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
486 aa  275  1e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  40.47 
 
 
464 aa  274  2e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  40.47 
 
 
464 aa  274  2e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
458 aa  275  2e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  40.47 
 
 
464 aa  274  2e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
474 aa  275  2e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  40.47 
 
 
464 aa  274  2e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
474 aa  275  2e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
467 aa  275  2e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  40.47 
 
 
464 aa  274  2e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  40.09 
 
 
462 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
474 aa  273  5e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  37.87 
 
 
483 aa  273  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 
468 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
465 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  40.25 
 
 
464 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  38.26 
 
 
431 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  40.39 
 
 
461 aa  270  6e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  39.92 
 
 
715 aa  270  6e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
467 aa  267  3e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
474 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  44.85 
 
 
484 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  44.85 
 
 
484 aa  266  6e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  44.85 
 
 
436 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
467 aa  264  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
473 aa  263  5e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 
477 aa  263  7e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
450 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.28 
 
 
469 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
467 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
461 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  39.89 
 
 
459 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
477 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.32 
 
 
462 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
449 aa  255  1e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
458 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.89 
 
 
446 aa  253  5e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
450 aa  253  5e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
468 aa  253  5e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
445 aa  253  5e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
468 aa  253  5e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
468 aa  253  5e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  33.19 
 
 
468 aa  253  8e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
477 aa  252  9e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  35.32 
 
 
475 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
466 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
477 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  35.99 
 
 
443 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
461 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
489 aa  250  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  36.77 
 
 
443 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  38.9 
 
 
463 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
465 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
465 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  35.42 
 
 
463 aa  246  5e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
456 aa  243  4e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
462 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
468 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  35.81 
 
 
470 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
472 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
472 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
472 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>