More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4369 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  89.8 
 
 		 439 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  82.71 
 
 		 446 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 441 aa  884    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  68.54 
 
 		 436 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  66.82 
 
 		 436 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  68.26 
 
 		 441 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  68.54 
 
 		 436 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  65.95 
 
 		 441 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  68.65 
 
 		 436 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  68.47 
 
 		 436 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  68.56 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  68.23 
 
 		 432 aa  548  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  69.23 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  68.4 
 
 		 424 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  65.29 
 
 		 437 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  65.53 
 
 		 437 aa  528  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  65.43 
 
 		 419 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  59.23 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  59.05 
 
 		 437 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  59.23 
 
 		 437 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  59.07 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  60.43 
 
 		 441 aa  484  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  58.49 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  60.63 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  57.65 
 
 		 447 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  60.1 
 
 		 430 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  58.6 
 
 		 443 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  60.83 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  56.63 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  60.83 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  56.55 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  61 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  62.41 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  53.45 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  57.6 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  55.29 
 
 		 447 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  56.46 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  55 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  55.48 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  52.1 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  52.1 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  51.85 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  51.12 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  52.46 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  52.46 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  49.29 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  53.9 
 
 		 417 aa  388  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  49.28 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  44.91 
 
 		 430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 		 430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 		 429 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 421 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  38.12 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 431 aa  243  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.66 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  29.34 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  29.34 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  29.34 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  29.34 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  29.34 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.79 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  28.26 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  28.04 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.3 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.3 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  27.54 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  27.38 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.38 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.38 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  29.34 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  28.26 
 
 		 400 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.85 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 407 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 391 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  24.2 
 
 		 398 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 398 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  23.95 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2467  putative oxalate:formate antiporter  27.87 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000134244  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  23.95 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  23.95 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>