More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4355 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4672  integral membrane protein TerC  81.93 
 
 		 250 aa  360  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  72.87 
 
 		 247 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  69.08 
 
 		 250 aa  344  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  70.25 
 
 		 250 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  70.25 
 
 		 250 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  71.07 
 
 		 249 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  70.25 
 
 		 250 aa  340  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  70.75 
 
 		 252 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  68.18 
 
 		 254 aa  330  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  71.07 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  68.7 
 
 		 251 aa  328  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  70.04 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  72.73 
 
 		 251 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  66.26 
 
 		 243 aa  321  7e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  66.4 
 
 		 251 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  66.4 
 
 		 251 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  69.83 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  68.35 
 
 		 267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  67.93 
 
 		 251 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  65.23 
 
 		 255 aa  311  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  67.09 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  69.75 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  66.53 
 
 		 274 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  69.75 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  71.31 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1566  integral membrane protein TerC  73.14 
 
 		 248 aa  308  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.22924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1673  Integral membrane protein TerC  73 
 
 		 248 aa  307  9e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1135  TerC family membrane protein  69.92 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2908  inner membrane protein  69.92 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2752  TerC family membrane protein  69.92 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4403  integral membrane protein TerC  66.26 
 
 		 263 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4488  Integral membrane protein TerC  65.85 
 
 		 250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0807  hypothetical protein  65.45 
 
 		 250 aa  299  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1845  Integral membrane protein TerC  73.31 
 
 		 248 aa  298  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2902  integral membrane protein TerC  68.83 
 
 		 246 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.807584  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1760  hypothetical protein  67.84 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  62.75 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1196  integral membrane protein TerC  67.65 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4110  integral membrane protein TerC  71.73 
 
 		 256 aa  279  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2551  integral membrane protein TerC  70.59 
 
 		 257 aa  278  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0767156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4942  Integral membrane protein TerC  71.43 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0537  integral membrane protein TerC  58.13 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  53.63 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  54 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  54.17 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  54.51 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.46 
 
 		 519 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  51.46 
 
 		 519 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  51.46 
 
 		 519 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.46 
 
 		 519 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.46 
 
 		 519 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  52.52 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  50 
 
 		 522 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  52.77 
 
 		 528 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  51.67 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  50 
 
 		 518 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 		 518 aa  245  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 518 aa  245  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 518 aa  245  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  50 
 
 		 518 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 		 518 aa  245  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50 
 
 		 516 aa  245  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50 
 
 		 518 aa  245  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 		 518 aa  245  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  51.87 
 
 		 577 aa  244  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  51.69 
 
 		 514 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  49.17 
 
 		 522 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  51.88 
 
 		 523 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  49 
 
 		 518 aa  242  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  51.91 
 
 		 518 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 518 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 523 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  50.84 
 
 		 523 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  53.09 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  50.84 
 
 		 523 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3736  TerC family membrane protein  50 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  56.45 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 529 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  52.67 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  52.56 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  53.91 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  50.85 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  54.27 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  52.46 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  51.07 
 
 		 518 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  49.79 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  48.37 
 
 		 518 aa  237  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  51.04 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  51.5 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  49.17 
 
 		 522 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  49.59 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  55.13 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  48.95 
 
 		 529 aa  234  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  47.93 
 
 		 510 aa  234  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  52.28 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  49.59 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  55.65 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  48.5 
 
 		 530 aa  231  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  50.43 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>