More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4260 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  79.17 
 
 		 293 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  76.39 
 
 		 288 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  71.33 
 
 		 289 aa  431  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  71.33 
 
 		 289 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  71.33 
 
 		 289 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  69.93 
 
 		 288 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  69.93 
 
 		 288 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  67.13 
 
 		 286 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  70.42 
 
 		 288 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  68.75 
 
 		 288 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  69.93 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  66.78 
 
 		 286 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  67.13 
 
 		 286 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  66.78 
 
 		 286 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  69.93 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  69.79 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  66.78 
 
 		 286 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  69.37 
 
 		 288 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  67.7 
 
 		 293 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  67.94 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  63.82 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  67.94 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  67.94 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  65.85 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  63.29 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  65.85 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  67.6 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  67.94 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  64.34 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  67.94 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  67.94 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  63.82 
 
 		 295 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  67.94 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  64.69 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  67.13 
 
 		 290 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  63.14 
 
 		 295 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  61.94 
 
 		 293 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  65.85 
 
 		 305 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  60.84 
 
 		 288 aa  371  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  64.11 
 
 		 303 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  62.9 
 
 		 286 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  59.09 
 
 		 288 aa  355  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  61.84 
 
 		 286 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  59.3 
 
 		 287 aa  342  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  55.24 
 
 		 287 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  56.84 
 
 		 290 aa  337  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  54.9 
 
 		 286 aa  335  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  49.82 
 
 		 290 aa  298  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  44.25 
 
 		 293 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  46.56 
 
 		 311 aa  266  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1938  pirin family protein  45.1 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  45.1 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  44.09 
 
 		 282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  44.27 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  41 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  42.12 
 
 		 292 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  43.48 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  40.73 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  42.22 
 
 		 337 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  42.46 
 
 		 318 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  42.22 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  42.22 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  41.33 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  42.22 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  42.22 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  42.22 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  42.22 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  42.01 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  40.75 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  42.38 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  41.58 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  39.73 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  42.75 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  42.38 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  40.79 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  38.91 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  42.38 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  42.38 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  41.56 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  40.34 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  41.26 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  38.36 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  39.06 
 
 		 346 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  41.16 
 
 		 322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  39.73 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  37.92 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  37.92 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  37.92 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5014  Pirin domain protein  36.76 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  41.18 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  40.65 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  41.31 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  41.31 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  41.22 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  43.19 
 
 		 286 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  38.85 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  42.8 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  43.19 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.55 
 
 		 310 aa  168  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>