27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4190 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  100 
 
 		 343 aa  705    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  80.42 
 
 		 340 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  73.87 
 
 		 344 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  74.17 
 
 		 344 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  71.43 
 
 		 344 aa  495  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  64.65 
 
 		 365 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  61.95 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  57.49 
 
 		 373 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  55.95 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  48.8 
 
 		 355 aa  316  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  44.88 
 
 		 337 aa  301  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  40.84 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  46.53 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  43.73 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  44.51 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  44.74 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  44.74 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  44.51 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  42.81 
 
 		 341 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  42.32 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  42.81 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  46.33 
 
 		 340 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  44.52 
 
 		 342 aa  245  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.88 
 
 		 606 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.88 
 
 		 606 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  26.06 
 
 		 821 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  32.56 
 
 		 241 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>