34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4126 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4126  putative nitrogen fixation protein NifQ  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.850177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0239  nitrogen fixation protein nifQ, putative  39.36 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.305155  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1476  putative nitrogen fixation-related protein(NifQ)  39.36 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000951053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1448  NifQ  39.6 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0280  NifQ family protein  38 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239171  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1355  NifQ family protein  36.51 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1209  NifQ family protein  36.75 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1229  NifQ family protein  31.64 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411993  hitchhiker  0.000327606 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1511  nitrogen fixation protein NifQ  31.64 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.203705  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7734  NifQ family protein  36.41 
 
 		 192 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2319  NifQ family protein  36.02 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00231718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0482  NifQ family protein  34.29 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2281  NifQ  45.24 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5092  NifQ family protein  32.43 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0978  NifQ  32.37 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789318  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1082  NifQ  39.53 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4454  NifQ  32 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5878  putative nitrogen fixation protein nifQ  31.45 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51040  Nitrogen fixation cofactor assembly protein  41.67 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0404512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1561  NifQ family protein  45.83 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0097  NifQ family protein  34.9 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3543  NifQ family protein  39.33 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  0.0106924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2185  NifQ family protein  31.76 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0315  NifU-like protein  29.35 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000902631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3988  NifQ family protein  38.82 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152989  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3623  NifQ family protein  34.74 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6182  NifQ family protein  33.75 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5817  hypothetical protein  33.75 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0755025  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0533  putative nitrogen fixation protein nifQ  36.9 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.057616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0514  NifQ family protein  32.1 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6662  NifQ family protein  33.14 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0612725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1254  NifQ family protein  34.48 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7727  hypothetical protein  34.56 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6153  NifQ family protein  33.9 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.16118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>