90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4111 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  100 
 
 		 174 aa  353  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  51.55 
 
 		 189 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  50.91 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  43.71 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  40.76 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  42.38 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  39.47 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  35.29 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  37.5 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  37.42 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  34.19 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  37.11 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  33.55 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  38.62 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  31.17 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  33.57 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  33.57 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  40 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  29.49 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  29.03 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  35.2 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  33.11 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  29.94 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  34.38 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1952  MOSC domain containing protein  38.69 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  33.33 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  32.64 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  32.17 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2271  MOSC domain containing protein  37.23 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1356  hypothetical protein  32.68 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  31.08 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  35.51 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  32.12 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  33.56 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  33.56 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  33.56 
 
 		 148 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  31.69 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0259  MOSC domain containing protein  30.43 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.215992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  31.82 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  36.09 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0426  MOSC domain containing protein  31.25 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0198409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  32.71 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  29.69 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  27.15 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  33.09 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  31.48 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  31.76 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  27.69 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2266  MOSC domain-containing protein  29.17 
 
 		 145 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2094  MOSC  28.78 
 
 		 152 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2483  hypothetical protein  29.66 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0431097  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0326  MOSC domain containing protein  24.62 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0830  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MOSC-domain-containing protein  24.64 
 
 		 308 aa  48.5  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  33.1 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  31.01 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0779  MOSC domain-containing protein  25.95 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.161048  normal  0.0150919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2418  MOSC domain-containing protein  27.41 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1399  MOSC domain-containing protein  24.52 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.092789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0371  MOSC domain-containing protein  27.81 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  28.87 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2133  MOSC  32.03 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1266  MOSC domain containing protein  28.57 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  28.03 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1892  MOSC domain-containing protein  31.68 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00267695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1602  MOSC domain containing protein  24.05 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  26.85 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  30.34 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1402  MOSC domain containing protein  28.8 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2930  MOSC domain containing protein  29.52 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0913  MOSC domain containing protein  27.1 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  26.17 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0654  MOSC domain-containing protein  26.36 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000905439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  27.15 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2768  MOSC domain containing protein  34.31 
 
 		 144 aa  44.3  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  27.18 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  26.47 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  26.47 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0671  MOSC domain containing protein  28.03 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0414  MOSC domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0255  MOSC domain containing protein  28.95 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  30.39 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1355  MOSC domain containing protein  28.57 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0782676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2367  MOSC domain containing protein  27.27 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0181  MOSC  28.48 
 
 		 213 aa  42  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1394  MOSC domain-containing protein  27.87 
 
 		 146 aa  42  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  29.86 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  28.33 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2235  MOSC domain-containing protein  33 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>