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for query gene Rmet_4102 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 176 aa  128  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 186 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 196 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  33.86 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 212 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.65 
 
 		 198 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  37.71 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  31.63 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  33.15 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 190 aa  94.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 193 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  31.44 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  32.17 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  28.65 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  26.78 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
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NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
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NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  24.6 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
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NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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