More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4091 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1700  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  85.82 
 
 
411 aa  727    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.167604  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02984  putative NADH oxidase-related oxidoreductase protein  85.68 
 
 
411 aa  695    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.476298  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  85.82 
 
 
411 aa  725    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584547  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2709  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  83.94 
 
 
414 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3405  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  85.54 
 
 
411 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4091  flavine mononucleotide (FMN) oxidoreductase  100 
 
 
420 aa  852    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4065  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  85.89 
 
 
414 aa  722    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3456  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  85.89 
 
 
414 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0206  NADH oxidase  71.08 
 
 
424 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.847587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.59 
 
 
412 aa  591  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3221  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.37 
 
 
411 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2994  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  68.64 
 
 
418 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135247  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3994  putative FMN oxidoreductase  72.11 
 
 
411 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29030  putative FMN oxidoreductase  71.61 
 
 
411 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2699  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  68.15 
 
 
418 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  65.04 
 
 
411 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.308069 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2441  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.45 
 
 
412 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420903  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3476  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.03 
 
 
425 aa  421  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01808  oxidoreductase, FMN-binding protein  54.43 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2215  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50 
 
 
407 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4732  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.95 
 
 
416 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.880422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2143  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.66 
 
 
421 aa  346  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0619  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.52 
 
 
441 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2131  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.52 
 
 
441 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2218  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.28 
 
 
454 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.47 
 
 
414 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2021  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.55 
 
 
441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0699  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.55 
 
 
454 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0803  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.89 
 
 
441 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1578  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.03 
 
 
441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568698  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1170  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.44 
 
 
423 aa  331  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3247  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.75 
 
 
435 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4518  FMN oxidoreductase  39.75 
 
 
401 aa  322  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4571  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.99 
 
 
421 aa  286  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142978  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1739  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.71 
 
 
427 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0580  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.7 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.28 
 
 
397 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3978  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  36.15 
 
 
399 aa  242  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06167  FMN binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08260)  37.95 
 
 
369 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.69332  normal  0.461703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0069  NADH:flavin oxidoreductase  37.5 
 
 
377 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000720309  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1057  NADH oxidase  32.84 
 
 
370 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.263172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.95 
 
 
372 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.675627 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0980  NADH peroxidase  34.33 
 
 
360 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05496  NADH-dependent flavin oxidoreductase  33.43 
 
 
376 aa  196  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3330  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  37.25 
 
 
374 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1087  NADH:flavin oxidoreductase  33.53 
 
 
365 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0123  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.17 
 
 
374 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00317178  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.38 
 
 
364 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.39 
 
 
374 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0697  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  30.97 
 
 
368 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00245869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0778  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.35 
 
 
386 aa  186  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000175995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.21 
 
 
366 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2818  NADH peroxidase  32.2 
 
 
365 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.609535  normal  0.162723 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.71 
 
 
387 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.15 
 
 
330 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0435  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.2 
 
 
353 aa  170  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  30.94 
 
 
650 aa  169  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2707  NADH:flavin oxidoreductase  29.14 
 
 
409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1496  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.3 
 
 
399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.41 
 
 
646 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1595  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.94 
 
 
667 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0868  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  30.86 
 
 
335 aa  159  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.730901  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1021  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.33 
 
 
407 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0472  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.19 
 
 
344 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1107  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29 
 
 
329 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1442  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.4 
 
 
357 aa  156  8e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.42 
 
 
654 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1304  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.29 
 
 
334 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0121  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.59 
 
 
367 aa  153  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1289  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.67 
 
 
377 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.306648  normal  0.411333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.95 
 
 
937 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.53 
 
 
365 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03800  conserved hypothetical protein  30.89 
 
 
450 aa  150  5e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.94 
 
 
644 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.43 
 
 
402 aa  149  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4435  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.02 
 
 
355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2193  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.62 
 
 
645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000298441  normal  0.0270911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.01 
 
 
355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0369  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.98 
 
 
662 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.550194 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0870  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.22 
 
 
340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  32.46 
 
 
368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0350  NADPH dehydrogenase NamA  31.56 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0765  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.05 
 
 
646 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1044  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.96 
 
 
665 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.14 
 
 
671 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2275  NADPH dehydrogenase NamA  33.2 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000882972  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  33.33 
 
 
354 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.3 
 
 
356 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0148  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.82 
 
 
357 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.45 
 
 
706 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.566036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  31.3 
 
 
368 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1977  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.39 
 
 
411 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0533  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.91 
 
 
333 aa  143  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.56 
 
 
368 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1624  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.22 
 
 
423 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0238661  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.46 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.818781  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  32.36 
 
 
771 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4279  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.16 
 
 
647 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3290  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.33 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2060  NADH-dependent flavin oxidoreductase  28.4 
 
 
343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>