273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4078 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  81.8 
 
 		 467 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  82.66 
 
 		 467 aa  753    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  100 
 
 		 475 aa  949    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  82.23 
 
 		 467 aa  748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  82.66 
 
 		 467 aa  752    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  60.73 
 
 		 553 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  60.73 
 
 		 553 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  59.8 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  59.96 
 
 		 549 aa  535  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  59.92 
 
 		 575 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  59.92 
 
 		 575 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  60.58 
 
 		 552 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  57.17 
 
 		 551 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  59.63 
 
 		 553 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  58.88 
 
 		 553 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  59.63 
 
 		 553 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  57.43 
 
 		 552 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  58.04 
 
 		 552 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  57.61 
 
 		 549 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  54.86 
 
 		 550 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  56.55 
 
 		 549 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  55.09 
 
 		 548 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  55.47 
 
 		 553 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  58.49 
 
 		 545 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  54.23 
 
 		 545 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  57.23 
 
 		 537 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  58.66 
 
 		 545 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  55.58 
 
 		 547 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  56.57 
 
 		 552 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  58.46 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  54.22 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  56.22 
 
 		 558 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  55.51 
 
 		 546 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  55.98 
 
 		 566 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  53.54 
 
 		 538 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  53.14 
 
 		 556 aa  460  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  55.88 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  53.04 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  53.33 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  53.26 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  53.29 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  53.74 
 
 		 518 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  51.97 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  51.19 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  51.68 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  43.45 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 		 424 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 411 aa  272  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  39.08 
 
 		 424 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  40.1 
 
 		 406 aa  253  7e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  37.91 
 
 		 401 aa  246  9e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 442 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 453 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  33.11 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  34.89 
 
 		 938 aa  167  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 425 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 419 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 407 aa  143  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 421 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 421 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  28.76 
 
 		 438 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  27.89 
 
 		 412 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  37.22 
 
 		 679 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  27.12 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.3 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.09 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.59 
 
 		 398 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  26.36 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.91 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25 
 
 		 408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  31.78 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  30.13 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 398 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.86 
 
 		 412 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.86 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.86 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>