83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4044 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  100 
 
 		 302 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  100 
 
 		 302 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  95.7 
 
 		 302 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  97.19 
 
 		 286 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  75.51 
 
 		 308 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  47.7 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  50.68 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  50.68 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  50.68 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  50.68 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  42.23 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  47.57 
 
 		 292 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  45.59 
 
 		 289 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  45.59 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  43.22 
 
 		 289 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  43.22 
 
 		 289 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  37.72 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  35.81 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  34.59 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  34.59 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  35.89 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  35.71 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  43.27 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  43.27 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  43.27 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  43.27 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  40.37 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  34.47 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  36.49 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  38.4 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  34.26 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  33.33 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  31.19 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  31.19 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  42.79 
 
 		 497 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  33.7 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  34.17 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  35.53 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  29.96 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  32.42 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  37.2 
 
 		 440 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  35.81 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  24.1 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  38.68 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  25.87 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  27.43 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  27.43 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  27.43 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  27.43 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  34.96 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  25.55 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  23.88 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  26.17 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  24.03 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  24.03 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  25 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  24.36 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  24.36 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  24.36 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  25.61 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  27.91 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  34 
 
 		 98 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  23.48 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  20.43 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  24.54 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  25.96 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  22.98 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  28.86 
 
 		 196 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  23.62 
 
 		 379 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  21.13 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  21.13 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  24.14 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  22.22 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1365  hypothetical protein  24.22 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  20.92 
 
 		 551 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  25.9 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  25.9 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11320  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  29.59 
 
 		 846 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.952833  normal  0.628396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  26.52 
 
 		 803 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  22.14 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  25.31 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  23.26 
 
 		 335 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>