147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4032 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  202  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  83.81 
 
 		 105 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  72.38 
 
 		 110 aa  159  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  72.38 
 
 		 126 aa  159  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  71.43 
 
 		 105 aa  157  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  71.43 
 
 		 110 aa  155  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  74.29 
 
 		 110 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  73.33 
 
 		 110 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  72.38 
 
 		 108 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  70.48 
 
 		 110 aa  154  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  68.57 
 
 		 117 aa  154  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  68.57 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  72.38 
 
 		 111 aa  152  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  69.52 
 
 		 110 aa  150  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  69.52 
 
 		 106 aa  150  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  68.57 
 
 		 110 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  70.48 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  67.62 
 
 		 110 aa  148  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  70.48 
 
 		 106 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  64.76 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  59.05 
 
 		 110 aa  137  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  62.5 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  62.86 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  63.81 
 
 		 110 aa  129  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  63.81 
 
 		 110 aa  129  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1598  protein of unknown function UPF0060  66.34 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0157763  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  64.76 
 
 		 222 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  59.62 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2289  hypothetical protein  66.34 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.616642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  62.63 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1254  hypothetical protein  67.39 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0263746  normal  0.108455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2746  hypothetical protein  62 
 
 		 106 aa  123  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.304303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4425  hypothetical protein  65.22 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00189805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1283  hypothetical protein  65.22 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000413611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1618  hypothetical protein  61.39 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333014  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01551  hypothetical protein  60.4 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2061  protein of unknown function UPF0060  60.4 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.151826  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0802  hypothetical protein  65.22 
 
 		 110 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1931  hypothetical protein  62.38 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0387347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01541  hypothetical protein  60.4 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1655  hypothetical protein  60.4 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0427679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1789  hypothetical protein  60.4 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.477899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2048  hypothetical protein  60.4 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.791171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2291  hypothetical protein  60.4 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  hitchhiker  0.000000000030396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  60 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1668  hypothetical protein  64.36 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1615  hypothetical protein  64.36 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1674  hypothetical protein  64.36 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1606  hypothetical protein  64.36 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  56.19 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  56.19 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  72.38 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0586655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1835  hypothetical protein  62.38 
 
 		 108 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.132551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  52.83 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2037  hypothetical protein  62.86 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4243  protein of unknown function UPF0060  62.86 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4131  protein of unknown function UPF0060  62.86 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal  0.23278 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  47.12 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2889  protein of unknown function UPF0060  52.83 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  hitchhiker  0.00858506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0342  hypothetical protein  59.62 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  49.51 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  50.5 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  47.52 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2268  hypothetical protein  60.58 
 
 		 111 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01651  membrane protein YnfA  75.86 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2837  protein of unknown function UPF0060  57.14 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.578312  normal  0.331063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  46.15 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2230  hypothetical protein  47.17 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1789  hypothetical protein  55.91 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0659  hypothetical protein  55.66 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0436  hypothetical protein  55.91 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2370  hypothetical protein  53.77 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4121  protein of unknown function UPF0060  55.66 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2004  hypothetical protein  54.81 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0347623  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  44.76 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  43.4 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  49.06 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4105  hypothetical protein  46 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  42 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6500  protein of unknown function UPF0060  54.72 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  42.06 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  41.9 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  41.28 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1459  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  41.51 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  39.62 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  41.9 
 
 		 112 aa  76.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  42.45 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3409  hypothetical protein  47.17 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  52.69 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  43.93 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0929  hypothetical protein  52.69 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7600  membrane protein  38.1 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2792  hypothetical protein  63.46 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0343733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  40.95 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  39.05 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1597  hypothetical protein  63.46 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0598  hypothetical protein  63.46 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1494  hypothetical protein  63.46 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0554  hypothetical protein  63.46 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>