More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4016 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  100 
 
 		 392 aa  795    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  78.97 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  47.33 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  46.98 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  44.36 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  44.87 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  41.22 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  44.01 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  44.59 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.27 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  51.92 
 
 		 263 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  51.54 
 
 		 263 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  51.92 
 
 		 263 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  51.54 
 
 		 263 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  49.23 
 
 		 263 aa  256  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  50.79 
 
 		 269 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  40.93 
 
 		 386 aa  254  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  50.77 
 
 		 263 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  51.15 
 
 		 262 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  43.09 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  50.95 
 
 		 263 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  37.85 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  49.8 
 
 		 258 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  48.08 
 
 		 270 aa  245  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  47.86 
 
 		 259 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  49.2 
 
 		 262 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  47.1 
 
 		 270 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.05 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.05 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.05 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.05 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.05 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  46.72 
 
 		 270 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.77 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  48.65 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  48.65 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  48.65 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  49.03 
 
 		 261 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  49.03 
 
 		 261 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  49.23 
 
 		 263 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  48.26 
 
 		 261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  49.03 
 
 		 261 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  48.46 
 
 		 266 aa  230  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  47.29 
 
 		 265 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  48.08 
 
 		 266 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  36.72 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0618  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.73 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  46 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  41.47 
 
 		 261 aa  223  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  44.18 
 
 		 255 aa  222  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  44.58 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  45.17 
 
 		 263 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  45.38 
 
 		 263 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  49.23 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  45.17 
 
 		 261 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  45.17 
 
 		 261 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  45.17 
 
 		 261 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  45.17 
 
 		 261 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.17 
 
 		 261 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  45.17 
 
 		 261 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  43.85 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  42.42 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  80.16 
 
 		 128 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  44.06 
 
 		 263 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.63 
 
 		 261 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  78.12 
 
 		 129 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.12 
 
 		 129 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.12 
 
 		 129 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.57 
 
 		 128 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  44.05 
 
 		 261 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  79.03 
 
 		 128 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  79.03 
 
 		 128 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.57 
 
 		 128 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  44.19 
 
 		 258 aa  208  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.91 
 
 		 128 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  78.57 
 
 		 130 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  75.59 
 
 		 128 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.57 
 
 		 131 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  42.31 
 
 		 260 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.12 
 
 		 128 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.12 
 
 		 128 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.12 
 
 		 128 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  43.46 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.12 
 
 		 128 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  78.12 
 
 		 128 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  73.6 
 
 		 129 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  43.82 
 
 		 265 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  73.17 
 
 		 130 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  40.47 
 
 		 260 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  72.36 
 
 		 130 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  72.36 
 
 		 130 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  70.73 
 
 		 133 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  71.54 
 
 		 130 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  70.73 
 
 		 132 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  69.11 
 
 		 133 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  41.26 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  75 
 
 		 132 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  42.11 
 
 		 260 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  75 
 
 		 132 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  42.21 
 
 		 267 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>