More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3973 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3653  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  78.66 
 
 
539 aa  800    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.44224  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3973  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
606 aa  1219    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259305  normal  0.0136642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1303  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  61.55 
 
 
540 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00176405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.25 
 
 
558 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143114  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.44 
 
 
541 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1052  chemotaxis sensory transducer  59.82 
 
 
540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1429  putative chemotaxis transducer  60.29 
 
 
542 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16430  putative chemotaxis transducer  60.44 
 
 
542 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.889289  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.81 
 
 
540 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196472  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.45 
 
 
540 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159375  normal  0.199661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.45 
 
 
540 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.75 
 
 
558 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.93 
 
 
558 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.253027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0501  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  57.07 
 
 
558 aa  561  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585218  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.93 
 
 
558 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.96 
 
 
540 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.138218  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1493  methyl-accepting chemotaxis protein  60.44 
 
 
540 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.73 
 
 
558 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0217  putative methyl-accepting chemotaxis protein  57.6 
 
 
558 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482038  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0968  methyl-accepting chemotaxis transducer  57.6 
 
 
558 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1398  putative methyl-accepting chemotaxis protein  57.73 
 
 
555 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1595  putative methyl-accepting chemotaxis protein  57.73 
 
 
555 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2542  methyl-accepting chemotaxis protein  58.23 
 
 
546 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2687  methyl-accepting chemotaxis protein  58.23 
 
 
546 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0254  putative methyl-accepting chemotaxis protein  58.23 
 
 
546 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.26 
 
 
558 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.01 
 
 
558 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772371  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.01 
 
 
558 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613268  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
411 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0232938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1462  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 
564 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 
564 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1661  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.67 
 
 
622 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1674  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  38.78 
 
 
696 aa  209  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.266076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.42 
 
 
540 aa  173  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.53 
 
 
540 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.02 
 
 
519 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.66 
 
 
547 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 
674 aa  164  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 
661 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  32.96 
 
 
549 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.87 
 
 
519 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.47 
 
 
549 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.69 
 
 
542 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.1 
 
 
557 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 
547 aa  157  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 
673 aa  156  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.82 
 
 
549 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
679 aa  156  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.74 
 
 
544 aa  156  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.92 
 
 
570 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  32.84 
 
 
541 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.72 
 
 
525 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 
644 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 
696 aa  153  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  25.55 
 
 
544 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 
547 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 
666 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.12 
 
 
539 aa  151  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  30.4 
 
 
549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.86 
 
 
546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.75 
 
 
637 aa  148  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 
598 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.44 
 
 
550 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.98 
 
 
520 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 
571 aa  146  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.77 
 
 
539 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.22 
 
 
571 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.84 
 
 
561 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.3 
 
 
818 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  27.37 
 
 
541 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.77 
 
 
540 aa  145  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.38 
 
 
535 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.35 
 
 
662 aa  144  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  27.19 
 
 
539 aa  144  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0341  methyl-accepting chemotaxis protein  23.49 
 
 
574 aa  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.66 
 
 
660 aa  143  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.61 
 
 
546 aa  143  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  27.04 
 
 
541 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 
452 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00060467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.81 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  27.93 
 
 
660 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  28.46 
 
 
660 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.86 
 
 
533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.91 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.31 
 
 
533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.14 
 
 
676 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.6 
 
 
538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  27.65 
 
 
543 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.7 
 
 
679 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0977353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  27.67 
 
 
541 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.79 
 
 
640 aa  142  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.76 
 
 
544 aa  141  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  29.91 
 
 
549 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.97 
 
 
540 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  28.15 
 
 
533 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  27.62 
 
 
660 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0785  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  26.08 
 
 
551 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367078  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0369  methyl-accepting chemotaxis protein  23.84 
 
 
574 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631563  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.42 
 
 
677 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0173542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.93 
 
 
660 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>