33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3970 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  58.9 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  39.66 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  39.66 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  39.66 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  41.03 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  39.74 
 
 		 233 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  39.57 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  40.6 
 
 		 221 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  40.6 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  38.24 
 
 		 238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  37.71 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  39.91 
 
 		 247 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  36.05 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  36.05 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  36.05 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  36.05 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  39.41 
 
 		 221 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  35.77 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  38.82 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  39.57 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  37.76 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  38.14 
 
 		 229 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  38.4 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  37.87 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  30.86 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  30.86 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  36.86 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  29.71 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  38.79 
 
 		 201 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  38.79 
 
 		 201 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  32.9 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  23.78 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>