More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3969 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  58.53 
 
 		 762 aa  833    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  53.24 
 
 		 864 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  55.81 
 
 		 793 aa  802    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  53.02 
 
 		 769 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  53.24 
 
 		 864 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  56.52 
 
 		 789 aa  820    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  53.24 
 
 		 864 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  72.47 
 
 		 763 aa  1041    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  53.24 
 
 		 864 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  54.34 
 
 		 760 aa  762    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  57.89 
 
 		 1079 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  59.12 
 
 		 764 aa  831    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  53.64 
 
 		 769 aa  718    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  56.68 
 
 		 832 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  53.39 
 
 		 864 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  58.48 
 
 		 765 aa  832    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  100 
 
 		 768 aa  1518    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  53.02 
 
 		 769 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  58.53 
 
 		 767 aa  828    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  59.74 
 
 		 764 aa  857    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  53.9 
 
 		 766 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  52.75 
 
 		 769 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  59.69 
 
 		 769 aa  845    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  53.39 
 
 		 864 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  53.02 
 
 		 769 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  51.9 
 
 		 769 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  58.66 
 
 		 755 aa  846    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  53.54 
 
 		 804 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 808 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  44.1 
 
 		 752 aa  557  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 896 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 		 896 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 742 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 679 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 679 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 741 aa  363  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 772 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.27 
 
 		 734 aa  344  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 762 aa  337  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  28.68 
 
 		 769 aa  333  8e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  28.79 
 
 		 769 aa  333  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  28.41 
 
 		 769 aa  329  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  38.17 
 
 		 878 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  27.99 
 
 		 770 aa  321  3.9999999999999996e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 740 aa  320  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 784 aa  317  7e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.84 
 
 		 1992 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 777 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  28.36 
 
 		 774 aa  313  7.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 2539 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  29.8 
 
 		 764 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  29.5 
 
 		 770 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 783 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 686 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.15 
 
 		 1971 aa  306  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.87 
 
 		 2336 aa  300  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  31.94 
 
 		 2458 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 2212 aa  298  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  30.32 
 
 		 1987 aa  297  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  34.58 
 
 		 783 aa  295  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 781 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  34.58 
 
 		 785 aa  295  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 756 aa  295  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 801 aa  294  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  31.59 
 
 		 2301 aa  293  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  34.89 
 
 		 2476 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 1646 aa  290  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 1646 aa  290  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 2423 aa  288  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 1647 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.75 
 
 		 2301 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 706 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  34.23 
 
 		 839 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 777 aa  283  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 777 aa  281  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 1629 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 1609 aa  279  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 705 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 705 aa  278  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 1832 aa  278  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 1758 aa  277  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  29.61 
 
 		 803 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  29.41 
 
 		 764 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 1725 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 707 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 1725 aa  275  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  27.73 
 
 		 2284 aa  274  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 934 aa  274  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 865 aa  273  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 865 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 1974 aa  273  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.24 
 
 		 1960 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 1155 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 695 aa  267  7e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  26.59 
 
 		 798 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  28.57 
 
 		 601 aa  265  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 758 aa  264  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 1065 aa  264  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 666 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 770 aa  262  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>